OmicShare Class 基迪奥生物信息在线课堂

评论问答
资料

Xia Hui

不能全屏好难受，还看不清

1658天前

遇说还休回复 Xia Hui ：

可以小窗口播放再最大化

#1 1655天前回复

Xia Hui

这一节的资料和脚本在哪？

1658天前

admin 回复 Xia Hui ：

还是在第一章第一节和第二章第一节

#1 1437天前回复

kps123

上面显示错误：视频类型不受支持或文件路径无效

1653天前

admin 回复 kps123 ：

谢谢反馈，已经优化了，请重新观看~

#1 1653天前回复

故事在城外

怎么播放到第10秒钟就自动停了，看不了了

1648天前

kps123

这节的脚本在哪？

1647天前

admin 回复 kps123 ：

第一章的第一节以及第二章的第一节资料下载那里下载

#1 1575天前回复

admin 回复 kps123 ：

还是在第一章第一节和第二章第一节

#2 1437天前回复

杜丰平

没有讲述单倍型分析啊，能否增加单倍型分析这一章节？

1631天前

admin 回复杜丰平：

您好，您的意见我们已看到，后面会更新推出的~

#1 1613天前回复

xiek 回复杜丰平：

不知你想要的单倍型分析是想了解到什么程度，单倍型分析的内容很多，如果只是想看每个block中的单倍型数目，Haploview里面的haplotype就可以看出来。如果是想看基因中的功能单倍型，已经超出LDblock的范畴

#2 1610天前回复

杜丰平回复 xiek ：

GWAS一套下来还应该有一些进化的分析吧，例如Π、tajimiD、FST等，希望能追加，十分感谢

#3 1526天前回复

杜丰平回复 admin ：

GWAS一套下来还应该有一些进化的分析吧，例如Π、tajimiD、FST等，希望能追加，十分感谢

#4 1526天前回复

xiek 回复杜丰平：

会在今年7-8月份上下，不追加，另售

#5 1436天前回复

bluekirby

哪位好心人能告诉我 ppt在哪里下载？

1548天前

fzy 回复 bluekirby ：

每个章节的第一节那里有整章课程的资料

#1 1547天前回复

bluekirby 回复 fzy ：

我看了一下第一节哪里没有本节课程的ppt，主要我想要ppt中的命令行

#2 1547天前回复

fzy 回复 bluekirby ：

ppt好像没提供下载啊。。。

#3 1526天前回复

Ali_19

老师，

您好，我不知道为什么Haploview会报这个错误Pedigree file input error: invalid genotype on line 3

1507天前

xiek 回复 Ali\%19 ：

输入格式有问题

#1 1436天前回复

taolin

希望增加SNP注释及后续postGWAS相关分析内容。

1438天前

xiek 回复 taolin ：

注释需要各种库，有些库还不是免费的，所以心有余力不足

#1 1436天前回复

Dawn_wang

老师讲的很好，期待后续再说关于一些下游postGWAS分析的课程！

1374天前

A1543274736

setwd("D:/lecture11")

bin=c("all.in.one.total", "all.in.one.subpop1", "all.in.one.subpop2")

name <- c("total", "subpop1", "subpop2")

for (i in 1:length(bin)) {

temp_df <- read.table(bin[i], header = T, stringsAsFactors = F, comment.char = "")

temp_df$pop <- name[i]

if(i == 1){

mydf <- temp_df

} else {

mydf <- rbind(mydf, temp_df)

}

这个代码我是直接粘贴的但运行到这里就开始报错了

1325天前

a329594827

做Block的基因型数据需要过滤标记杂合度，缺失值吗

1281天前

Sauyuan123

请问老师做ld的vcf文件是怎么来的呢，是要自己排版吗，还是通过什么软件进行筛选排版呢

1269天前

老师你好，玉米做LD衰减时用PopLDdeacy MaxDist用多少合适

1249天前

砜烊

老师你好，玉米做LD衰减时MaxDist用多少合适

1249天前

jianxia

没有翻墙打不开那个网址，请问老师有没有可以把散点图换成折线图的方法，如果可以在一LD热图中的上面加上多个环境的折线图最好

1203天前

xiek

LD block相关的图形，建议用这个软件绘制

https://github.com/BGI-shenzhen/LDBlockShow

1022天前

hai178912522

这个软件怎么安装呢？poplddecay

859天前

sangzq

脚本在哪里，没有呀？

856天前

翱翔小马驹

资料显示没有？？？

815天前

eeedk 回复翱翔小马驹：

资料在第一章的第一节以及第二章的第一节资料下载那里下载\n

#1 762天前回复

xiaohui295

<p>只购买这一节就下载不了本节的资料吗</p>

223天前

暂无下载

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