OmicShare 拥有157个生信工具,其中引用次数较高的工具是热图、GO和KEGG富集分析以及韦恩图。截至2022年5月,热图工具被引用了1130次,GO富集分析工具被引用了1360次,pathway富集被引用1340次,韦恩图工具被引用814次,PCA分析、趋势分析、散点图、聚类分析等工具也被多次引用。

4500+

篇文章
在2016年12月(omicshare云平台上线后8个月),有3篇SCI文章引用omicshare;2017年英文版omicshare上线后,引用量上升,截至2023年10月,逾3600篇SCI文章引用Omicshare云平台。

10000+

影响因子
引用期刊有《Cell metabolism》(IF= 22.415)、Cell research(IF= 17.848)、Hepatology(IF= 14.079)、European Respiratory Journal(IF= 11.807)Nature Communications(IF=12.353)、Plos Biology(IF=9.163)等。

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omicshare上线至今,积累了一批忠实用户,截至2024年12月 ,omicshare注册用户数为171618 人,网站访问量逾550万,线上完成逾120万项目。

引用工具

目前,OmicShare tools已有83个,OmicShare tools中引用次数较高的工具是热图、GO和KEGG富集分析以及韦恩图。其中热图工具被引用了212次,GO富集分析工具被引用了192次,pathway富集被引用168次,韦恩图工具被引用73次,PCA分析、趋势分析、散点图、聚类分析等工具也被多次引用。

引用案例

Gene function enrichment analysis(2018,nature Communications)

Heatmap (2018, Hepatology)

Cluster analyses (2016,Journal of Experimental Botany)

Venn analyses (2017,Scientific reports)

Scatter plot (2017,Scientific reports)

KEGG pathway enrichment analyses (2017,Journal of Proteome Research)

Trend analysis (2017, scientific reports)

KEGG pathway enrichment analyses (2017, scientific reports)

GO enrichment analyses (2017, scientific reports)

引用文章列表(IF>5)

年份 期刊 影响因子 引用工具 发表单位 文章链接
2019 Cell metabolism 21.567 KEGG 上海-复旦大学 链接
2019 Cell research 20.507 KEGG 北京-中科院 链接
2018 Hepatology 14.679 Bioinformatic analysis 陕西-第四军医大学 链接
2020 Nature plants 13.256 GO 美国-加利福尼亚大学伯克利分校 链接
2018 Nature ecology & evolution  12.541 GO、KEGG 上海生命科学研究院 链接
2019 European Respiratory Journal 12.339 heatmap 陕西-西北农林科技大学 链接
2018 Nature communications 12.121 difference analysis 广东-中山大学附属第一医院 链接
2018 Nature Communications 12.121 Gene function enrichment analysis 华南师范大学 链接
2018 Nature Communications 12.121 KEGG 天津科技大学和南开大学 链接
2020 The Plant Cell 9.618 GO 福建农林大学 链接
2019 Water Research 9.130 NMDS 北京-清华大学 链接
2020 Journal of Hazardous Materials 9.038 OPLS-DA), PCA,heatmap 四川-西南科技大学 链接
2020 Journal of Hazardous Materials 9.038 PCA 四川-西南科技大学 链接
2020 Journal of Hazardous Materials 9.038 difference analysis 江苏-南京河海大学 链接
2019 Journal of Hazardous Materials 9.038 PCA、heatmap 四川-西南科技大学 链接
2020 New Phytologist 8.512 GO,KEGG 四川-西南科技大学 链接
2020 Plant biotechnology journal 8.154 Tajima's D line plot 黑龙江-东北林业大学 链接
2019 Environment international  7.577 CCA 江苏-南京农大 链接
2020 Bioresource Technology 7.539 sequence analysis 广东-华南农业大学 链接
2020 Bioresource Technology 7.539 sequence analysis 北京-中国农大 链接
2020 Bioresource Technology 7.539 Correlation analysis 河南农业大学 链接
2020 Bioresource Technology 7.539 sequence analysis 北京-中国农大 链接
2019 Bioresource Technology 7.539 heat map 华南农业大学 链接
2019 Bioresource Technology 7.539 heat map 华南农业大学 链接
2019 Bioresource technology 7.539 heatmap 广东-华南农大 链接
2019 Bioresource Technology 7.539 heatmap 广东-华南农大 链接
2019 Bioresource technology 7.539 DNA sequence analyses 广东-华南农业大学 链接
2019 Bioresource technology 7.539 cor 天津大学 链接
2019 Bioresource technology 7.539 PCOA 广东-华南农业大学 链接
2019 Bioresource technology 7.539 COG and KEGG pathway 湖南大学 链接
2019 International Journal of Cancer 7.360 heat map 广东-中山大学 链接
2020 Acta Pharmaceutica Sinica B 7.097 Quadrant plot 天津-南开大学 链接
2016 eLife 7.080 Heatmap 云南农业大学 链接
2017 PLOS BIOLOGY 7.076 GO and KEGG analyses 山东-中国科学院海洋研究所 链接
2020 Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 7.068 Bioinformatic analyses 陕西-第四军医大学 链接
2020 Plant Physiology 6.902 heatmap 江苏-南京农大 链接
2019 Plant Biotechnology Journal 6.840 heat map 南京农业大学 链接
2020 Environmental Pollution 6.792 GO 黑龙江-东北林业大学 链接
2020 Science of The Total Environment 6.551 Circos 广东海洋大学 链接
2020 Science of The Total Environment 6.551 venn 北京-中国农业科学院 链接
2018 International Journal of Cancer 6.513 heatmap 江苏-东南大学 链接
2020 Food Chemistry 6.306 GO,KEGG 湖北-华中农大 链接
2019 Cell Death & Disease 6.304 cluster、GO 湖南-中南大学 链接
2020 Molecular Ecology Resources 6.286 KEGG 浙江大学 链接
2020 Molecular Ecology Resources 6.286 GO,KEGG 北京-中国农业科学院 链接
2020 Genomics 6.205 KEGG 吉林大学 链接
2020 Genomics 6.205 KEGG 吉林大学 链接
2020 Genomics 6.205 Hierarchical cluster analyses 山东-中国科学院青岛海洋研究所 链接
2020 Genomics 6.205 trend 江苏-南京农大 链接
2020 Genomics 6.205 heatmap 美国-夏威夷大学马诺阿分校 链接
2019 The Plant Journal 6.141 heatmap 湖北-华中农大 链接
2019 The Plant Journal 6.141 nine-quadrant analysis  湖南农大 链接
2018 The Plant Journal 6.141 Hierarchical cluster analyses 昆明-中国科学院昆明植物研究所 链接
2020 Journal of Experimental Botany 5.908 heatmap,venn,Box plots 河南-中国农业科学院棉花研究所 链接
2019 Journal of experimental botany 5.830 Box plots and Venn diagrams 河南-中国农业科学院棉花研究所 链接
2016 Journal of Experimental Botany 5.830 K-means clustering University of Bonn(德国) 链接
2019 Chemosphere 5.778 GO、KEGG 华北电力大学 链接
2019 Chemosphere 5.778 Heatmap 浙江大学 链接
2019 Chemosphere 5.778 heatmap 黑龙江-东北林业大学 链接
2019 Chemosphere 5.778 heatmap 黑龙江-东北林业大学 链接
2019 Chemosphere 5.778 trend 云南农业大学 链接
2019 Environmental Pollution 5.714 heatmap 东北林业大学 链接
2018 Cell death & disease 5.638 heatmap 广东-中山大学附属第六医院 链接
2019 Science of The Total Environment 5.589 heatmap 四川农业大学 链接
2019 Science of The Total Environment 5.589 CCA 天津大学 链接
2019 Pharmacological Research 5.574 KEGG 广州中医药大学 链接
2020 Journal of Cellular Physiology 5.546 difference analysis 内蒙古大学 链接
2018 Scientific data 5.541 GO 北京-中国林业科学研究院 链接
2018 Scientific data 5.541 PCA、three-dimension PCA 北京-中国林业科学研究院 链接
2019 PLoS genetics 5.540 GO、KEGG 广东-华南师范大学 链接
2019 Aging (Albany NY) 5.515 GO、KEGG 北京-国家老年医学中心 链接
2019 Biotechnology for biofuels 5.497 GO、KEGG、Trend 广东-暨南大学 链接
2019 Biotechnology for biofuels 5.497 GO、KEGG 重庆-西南大学 链接
2019 Food Chemistry 5.399 heatmap 北京工商大学 链接
2020 RNA biology 5.350 heatmap,trend 北京-中国科学院大学 链接
2020 Microbial Biotechnology 5.328 PCoA 广东-华南农大 链接
2020 Food and Energy Security 5.212 GO,PCA, 江苏-扬州大学 链接
2019 Journal of Pest Science 5.133 Heatmap 南京农业大学 链接
2017 Cellular Physiology and Biochemistry 5.104 heatmap and volcano plot 辽宁-中国医科大学 链接
2020 Frontiers in Immunology 5.085 GO 浙江大学 链接
2019 Journal of Advanced Research 5.045 senior bubble map 广西医科大学 链接