表观组学是近年来新兴的一门学科,因能与DNA以及RNA等传统组学之间进行互相印证补充等,在组学中处于比较重要的地位,目前也处于发高分文章的红利期,鉴于此,本系列课程将从技术原理、常用分析软件、研究思路等对表观组学进行全面的介绍,希望对老师们的课题研究有所帮助!
表型差异研究是通用的生物学研究起点,生物学课题中常用的表型差异有时间、空间、处理类型/梯度、代谢物、生理生化指标等。掌握表观组学实验设计思路、数据挖掘方法、多组学关联分析方法尤为重要。本课程分为三个章节,基迪奥将从基础概述出发,讲述表观组学的研究思路、组学技术介绍及数据挖掘。通过理论与实操相结合,可实现零生信基础也能上手表观组学的数据挖掘、个性化分析及图形绘制美化。
第1章基础入门理论与实操
对表观研究前景意义、组学实验/辅助实验流程、研究思路;基础数据分析(reads、丰度表、peak等)、R语言入门等进行概括介绍。
第2章单组学专题理论与实操
主要涉及组间差异分析的理论和R实操以及高级个性分析中的Motif、核小体足迹、转录因子等介绍和基于MEME软件的Motif预测。
第3章多组学专题理论与实操
对ATAC-seq/DAP-seqWGBS-seq/m6A-seq+RNA-seq、m6A-seq+Ribo-seq通用关联思路,某些个性化关联思路,分型方法、可视化、结果解读、案例应用进行介绍以及相关性散点图等图形的绘制。
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