ProVIP
￥ 3499 /年
9.59元 /天
适用于云工具、注释、视频、书店
VIP
￥ 600 /年
1.64 元/天
适用于云工具、视频、书店
扫码支付更轻松
Gephi是一个交互式的网络图实时动态可视化（Real-time visualization）工具，广泛用于
社交网络分析（social network analysis，SNA)。近些年，很多微生物生态学相关的学者
使用Gephi做微生物群落的共发生网络分析（Co-occurrence network analysis ）。
由于软件容易上手且出图漂亮，随着时间推移，必将有越来越多自然科学领域的学者用Gephi去
展示基因共表达网络、代谢网络、ceRNA网络等等。
本教程的内容主要包括软件和插件的安装、网络图基础、软件界面和工具介绍、文章案例重现4个板块，
详细介绍了软件的使用方法和个性化网络图（如“曲边”共发生网络图、“朱缨花”网络图）的绘制技巧，
希望能减少大家花费在摸索方法上的时间，对开始学习网络图绘制的小伙伴有所帮助！
Gephi是一个交互式的网络图实时动态可视化（Real-time visualization）工具，广泛用于社交网络分析（social network analysis，SNA)。近些年，很多微生物生态学相关的学者使用Gephi做微生物群落的共发生网络分析（Co-occurrence network analysis ）。
由于软件容易上手且出图漂亮，随着时间推移，必将有越来越多自然科学领域的学者用Gephi去展示基因共表达网络、代谢网络、ceRNA网络等等。
图1 使用Gephi绘制基因共表达网络
图2 对Cytoscape软件导出的网络进行可视化
以下是一些使用Gephi绘制网络图的示例：
图3 Gephi绘制共发生、共表达网络图
图4 Gephi绘制“炫彩”网络图
本教程的内容主要包括软件和插件的安装、网络图基础、软件界面和工具介绍、文章案例重现4个板块，共7节课，平均每节课时长约20分钟。视频中详细介绍了软件的使用方法和个性化网络图（如“曲边”共发生网络图、“朱缨花”网络图）的绘制技巧，希望能减少大家花费在摸索方法上的时间，对开始学习网络图绘制的小伙伴有所帮助！
图5软件界面功能详解（课件截图）
课程内容
最后，提醒大家这是实操课程，不是讲座，电影或是综艺节目！请边看视频边跟着操作，如果只用眼睛看，无聊、也没有意义，一觉醒来，了无痕迹！课堂中用到的示例文件可通过视频窗口左侧（或下方）的资料区下载，学习过程中有任何疑问，都可在课程页面联系OmicShare客服。
1）OmicShare课程可以整系列购买，或单独购买子课程，具体课程页面查阅。
2）目前OmicShare的课程提供支付宝或微信付款；如果需要通过单位转账，请联系客服安排。
3）购买任意课程都可开发票，并且只开电子发票。有且仅开以下4种：技术咨询费、技术服务费、测序服务费。
4）购买视频课程，观看有效期为2年。
疯狂的蚂蚁 开始学习 文章案例-共发生网络图的绘制
疯狂的蚂蚁 开始学习 软件、插件的安装与常见问题
ZZxm 开始学习 案例实操-为网络图添加图例
ZZxm 开始学习 文章案例-“朱缨花”网络图的绘制
ZZxm 开始学习 文章案例-共发生网络图的数据准备（基于R语言）
ZZxm 开始学习 文章案例-共发生网络图的绘制
ZZxm 开始学习 Gephi软件界面与功能详解（下）
ZZxm 开始学习 Gephi软件界面与功能详解（上）
ZZxm 开始学习 网络图的基本概念
ZZxm 开始学习 软件、插件的安装与常见问题
wn_ll 开始学习 Gephi软件界面与功能详解（上）
wn_ll 开始学习 Gephi软件界面与功能详解（下）
qinyi 开始学习 案例实操-为网络图添加图例
qinyi 开始学习 软件、插件的安装与常见问题
ZL317 开始学习 软件、插件的安装与常见问题
Tempest 开始学习 网络图的基本概念
基迪奥公众号
SCIPainter公众号
© 2015 - 2024 OmicShare 版权所有 粤ICP备12019869号-1 广州基迪奥生物科技有限公司
广州大学城智慧谷A5座
020-39341079
omicshare@genedenovo.com
