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21.03.10 B站直播课程 基于三代全长16S的微生物多样性分析

完整的16S其实有9个可变区，全长1500bp左右，常规的扩增子研究大多针对其中的2个可变区，最长约450bp左右。显而易见，我们挑选16S作为物种分类的参考，常规二代测序其实只测了很小的一个片段。对于两个同属不同种的物种，全基因组的差异可能也只有90%，在400bp的片段上，就只有几十个碱基差异，在数据库注释时，一条序列有可能同时比对上非常多的种，即没有区分度，就变成了“unclassified”。 

但是从另一类文章来看很多研究都重点开展了属、种水平的物种机制分析。本次课程就来讨论一下关于三代16S的测序技术讲解、文章研究思路、常见疑难解答、注意事项等。

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