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课程-omicsmart单细胞转录组数据挖掘实战

基迪奥omicsmart动态交互分析平台集流程分析、数据挖掘、图形美化、SCI级图形下载于一体,为单细胞转录组研究提供了一个操作简易的数据分析平台。

借助平台的实时交互分析,我们为大家展示综合使用分析点完成目标分析的关键思路。此外,我们从NCBI获得文献对应的原始测序数据或基因表达矩阵,为大家详细展示如何使用响应分析点和思路来实现文献数据挖掘过程。

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基迪奥omicsmart动态交互分析平台集流程分析、数据挖掘、图形美化、SCI级图形下载于一体,为单细胞转录组研究提供了一个操作简易的数据分析平台。

借助平台的实时交互分析,我们为大家展示综合使用分析点完成目标分析的关键思路。此外,我们从NCBI获得文献对应的原始测序数据或基因表达矩阵,为大家详细展示如何使用响应分析点和思路来实现文献数据挖掘过程。

本系列课程由基迪奥金牌讲师L.L主讲,课程将根据需要不时更新,目前主要内容如下:

 关键基因挖掘理论及实战:简单介绍10X单细胞转录组可以挖掘的关键基因类型及每种关键基因的分析意义和一般挖掘步骤,并以Omicsmart在线报告为工具,通过案例实操,按照标记基因分析、细胞异质性分析和样本差异分析三条思路进行关键基因挖掘;

 细胞亚群鉴定理论及实战:简要介绍单细胞分群的算法原理和亚群鉴定的重要性,介绍marker基因的选择策略和marker基因数据库、marker基因在细胞亚群的可视化及软件,并以Omicsmart在线报告为工具,通过案例实操,对简单的无争议亚群、复杂的有争议亚群和不易确定的无定义亚群三类细胞亚群进行亚群鉴定;

 文章重现之关键基因挖掘 解读文章《斑马鱼脑部再生的研究》,以斑马鱼为研究对象,利用细胞聚类分群和再分子亚群、亚群/子亚群marker挖掘、拟时分析和细胞互作等分析方法,解析神经祖细胞的异质性和可塑性,同时介绍如何在OS在线平台中重现文章中的数据挖掘工作;

 文章重现之细胞异质性分析:介绍如何利用细胞异质性分析来完成一篇有深度的文章,结合文章案例数据,基于omicsmart平台重现细胞异质性分析模式和数据挖掘思路。

以下展示课程视频的部分PPT内容:

 


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授课老师

基迪奥-L.L 金牌讲师
基迪奥-彗星 金牌讲师

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学员动态

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yilupingan 开始学习 单细胞转录组数据分析的多种思路

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张玉兰 开始学习 单细胞转录组拟时分析

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cp 开始学习 单细胞转录组拟时分析

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kingkun 开始学习 单细胞转录组数据挖掘的挑战与突破

何郡 开始学习 文章重现之关键基因挖掘

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