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两个物种(个体)的分化时间该如何计算获得呢?两个物种在分化前,共享1个共同祖先,这时候它们分化的时间是T=0。但如果它们因为地理隔离等因素分化为两个种群后,开始朝着两个不同的方向演化,类似于小学时学习的汽车相向而行的问题,两者以相似速度累积突变(近缘种的核酸突变速度是类似的),导致它们差异越来越大。当然,实际操作的时候,会涉及多种不同的计算方法。
为什么要使用同义突变率,因为非同义突变时由于压力的关系,导致差异不完全是由基因突变主导,还可能会因为选择压而保留变异或者加速变异的淘汰,所以使用同义突变率。又因为两条序列间的同义突变率是双方共同贡献的,所以是2r.
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为什么要使用同义突变率,因为非同义突变时由于压力的关系,导致差异不完全是由基因突变主导,还可能会因为选择压而保留变异或者加速变异的淘汰,所以使用同义突变率。又因为两条序列间的同义突变率是双方共同贡献的,所以是2r.
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