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随着二代测序价格各种跳楼，全基因组重测序已经越来越趋于白菜价了。所以，重测序也越来越广泛应用到遗传学研究的方方面面。从动植物QTL定位到群体遗传研究，从人类孟德尔病到复杂疾病，重测序（或者外显子测序、简化基因组测序等相关技术）在多个领域大显身手。重测序数据分析的流程，从原始数据到后续高级分析，实际要经历中间的若干重要步骤。本系列课程将会带你从原始数据到后续高级分析，解决重测序数据分析的流程中每个步骤可能出现的问题。
随着二代测序价格各种跳楼，全基因组重测序已经越来越趋于白菜价了。所以，重测序也越来越广泛应用到遗传学研究的方方面面。从动植物QTL定位到群体遗传研究，从人类孟德尔病到复杂疾病，重测序（或者外显子测序、简化基因组测序等相关技术）在多个领域大显身手。重测序数据分析的流程，从原始数据到后续高级分析，实际要经历中间的若干重要步骤。本系列课程将会带你从原始数据到后续高级分析，解决重测序数据分析的流程中每个步骤可能出现的问题。
本系列课程由基迪奥金牌讲师周老师、小张张、Jusser主讲，课程将根据需要不时更新，目前主要内容如下：
重测序比对与变异检测（上）——比对篇：主要介绍NGS数据比对的挑战、选择比对软件（NGS数据比对的原理）、比对输入和输出文件的格式、比对的常见错误和偏差、比对质量控制；
重测序比对与变异检测（下）——变异检测篇：介绍背景概念如MAF、SNP vs SNV、测序深度分布的原理；SNP和基因型（genotype）检出，通俗解释基于贝叶斯模型的SNP检出原理；测序深度与SNP（SNV）检测，解释为什么不同的应用目的，需要不同的测序深度；
遗传图谱构建与QTL定位技术详解：介绍遗传图谱构建的原理、遗传图谱构建过程中的问题、QTL定位常用的方法和QTL定位的难点；
混合分组分析（BSA）专题——用好BSA并没那么简单： BSA分析常见策略的介绍和优缺点比较，介绍各方法的适用范围，以及使用BSA方法的经验探讨；
基因定位——选择压力分析：主要介绍选择压力分析的基本原理与方法，以及所需材料与数据，结合案例解析分析步骤和优缺点，总结最适合的选择；挖掘物种与特定环境适应性相关的基因；
全基因组关联分析(GWAS)：主要介绍针对全体个体的全基因组关联分析原理、分析思路和方案设计，并总结最适合的选择；
核酸突变速率与物种分化时间预估：介绍物种分化时间的计算逻辑、影响物种变异速率的因素，并列举一些应用实例；
有效群体大小与物种进化史研究：介绍有效群体大小的定义，通过PSMC技术分析有效群体大小，讨论PSMC方法的优缺点及后续相关的分析方法优化；
探索新型热门分子——环状DNA研究思路解析：介绍环状DNA的类型、形成机制，检测环状DNA的常用方法优缺点对比，以及研究思路和应用；
动植物重测序中的ROH个性化分析策略：介绍ROH定义、检测的软件及参数设置、ROH的常见分析内容及研究思路，并结合案例进行解析；
遗传图谱联合转录组的基因定位思路探讨：主要从遗传图谱和转录组入手，分析两种技术的优缺点，并结合相关案例为大家解析两者的关联分析应用和意义；
如何联合图谱与GWAS提高QTL定位的精度：从图谱定位和GWAS技术入手，对两种技术进行简要的介绍。并且结合相关案例，解析两种技术关联分析的意义和研究思路；
eQTL分析——从基因型，转录组到表型的多维度分析：主要介绍eQTL的定义和分析内容、eQTL研究的实验设计及影响因素，结合案例解析eQTL研究发文套路；
QTL定位的方法与实操实现：主要介绍QTL分析的基本原理、所需材料与数据、复合区间作图算法与关键参数解析，并结合Omicsmart平台展示QTL分析作图；
如何简单实现多年多点数据的图谱定位：主要介绍QTL定位的原理和分析内容、阈值的选择和定位区间基因的筛选，并以Omicsmart在线报告为工具，展示遗传图谱与QTL定位交互分析；
基因组浏览器（IGV）使用教程：介绍IGV软件与安装启动方法，文件格式要求与数据导入及案例数据练习。
1）OmicShare课程可以整系列购买，或单独购买子课程，具体课程页面查阅。
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3）购买任意课程都可开发票，并且只开电子发票。有且仅开以下4种：技术咨询费、技术服务费、测序服务费。
4）购买视频课程，观看有效期为2年。
童毅 开始学习 QTL定位的方法与实操实现
aiwanting 开始学习 基因组浏览器（IGV）使用教程
石睿 开始学习 全基因组关联分析(GWAS)
石睿 开始学习 遗传图谱构建与QTL定位技术详解
石睿 开始学习 重测序比对与变异检测（下）——变异检测篇
石睿 开始学习 重测序比对与变异检测（上）——比对篇
石睿 开始学习 基因定位——选择压力分析
石睿 开始学习 eQTL分析——从基因型，转录组到表型的多维度分析
ZijianGao 开始学习 基因定位——选择压力分析
初秋 开始学习 动植物重测序进行QTL定位和选择压力分析的思路解析
lzqtpj 开始学习 重测序比对与变异检测（上）——比对篇
lzqtpj 开始学习 如何联合图谱与GWAS提高QTL定位的精度
lzqtpj 开始学习 全基因组关联分析(GWAS)
氪32 开始学习 混合分组分析（BSA）专题——用好BSA并没那么简单
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