OmicShare Class 基迪奥生物信息在线课堂

温馨提示：请先登陆

基迪奥-莫北

金牌讲师

21.04.22 B站直播课程基因功能富集分析与可视化实操

GO、KEGG富集分析是常规基于基因功能的数据挖掘方法，常用于差异基因集的基因功能研究和关键基因筛选。一般得到目的基因集后，接下来就需要分析这些基因到底参与了哪些通路，具有哪些功能，哪些功能/通路对表型的变化可能起主导作用等。最常见的分析方法就是做GO和KEGG富集分析(GO/KEGG Enrichment Analysis)。

GO和KEGG富集分析虽然应用比较广泛，但也并不完美。主要原因是它们比较依赖上游的差异分析，差异分析的阈值（一般为|log2FC|>=2且pvalue=<0.05）可能会卡掉很多重要的基因。而基因集富集分析（GSEA）将所有的基因视作“目的基因”，可避免以上问题，但分析过程稍复杂一点，目前仅在医学方向应用比较广泛。

以上这些分析，对于生信大佬来说可能不值一提，但对于刚接触生信的小伙伴来说，估计连如何准备目的基因文件都不知道。因此，本次B站直播的主题为《基因功能富集分析与可视化实操》，主要为大家演示如何进行GO/KEGG富集分析和GSEA，欢迎大家一起交流讨论。

评论问答
资料

暂无下载

相关课程

推荐课程