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课程-翻译组测序在基因表达调控和新型功能多肽研究中的应用
翻译组作为在中心法则中连接转录组和蛋白组的桥梁,其在组学研究中的价值正在被逐步重视,相关研究报道也逐年增加。翻译组的代表性技术Ribosome profiling(也被称为Ribo-seq)可以直接检测与核糖体结合、瞬间正在被翻译的RNA片段。
在翻译组领域,基迪奥合作客户已经有诸多研究成果产出。本次研讨会,我们将邀请翻译组研究相关文章的第一作者来分享他们在该领域的研究成果、思路和心得。
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翻译组作为在中心法则中连接转录组和蛋白组的桥梁,其在组学研究中的价值正在被逐步重视,相关研究报道也逐年增加。翻译组的代表性技术Ribosome profiling(也被称为Ribo-seq)可以直接检测与核糖体结合、瞬间正在被翻译的RNA片段。这一信息的获取,让我们窥探细胞质中奇妙的翻译过程成为可能。Ribo-seq数据的应用挖掘是多方面的,包括翻译丰度研究、翻译调控研究(多组学关联)以及新型功能性多肽挖掘。
在翻译组领域,基迪奥合作客户已经有诸多研究成果产出。本次研讨会,我们将邀请翻译组研究相关文章的第一作者来分享他们在该领域的研究成果、思路和心得。
会议关注议题:
(1)翻译组(ribo-seq)对于整合多组学数据的价值;
(2)翻译组(ribo-seq)相关多组学贯穿分析思路和技巧;
(3)利用翻译组技术进行新型功能多肽挖掘,以及多肽在生物医药研究中的价值;
(4)新型功能多肽功能机制研究的技巧、经验;

报告内容简介

报告1

转录-翻译-蛋白多组学关联分析茶树芽叶次生代谢调控规律

报告内容:

茶树幼芽次生代谢产物,尤其是类黄酮类物质的积累受到生长发育的调控。采用转录组、翻译组和蛋白质组学等方法,揭示茶叶芽叶发育过程中次生代谢的调控机制,可以为茶树生物学提供相关的背景数据,也为非模式植物的研究方法提供新的思路。

1)翻译组学简介

2)非模式植物的多组学联合分析

3)多组学联系分析的数据挖掘——以茶树芽叶为例

 

报告2circCDH1文章第一作者

环状RNA编码蛋白在胶质瘤进程中作用的机制研究

报告内容:

环状RNA在胶质瘤进程中发挥重要作用。随着测序技术的不断进步,传统意义上非编码的环状RNA被证实可以翻译蛋白并发挥独特作用。因环状RNA特异性接口结构的存在,使得其编码的蛋白为完全不同于母基因的全新蛋白。纵观整个环状RNA翻译研究现状,此领域尚待进一步开发。无论是阐释胶质瘤具体发生发展机制还是寻找潜在治疗靶标。该领域都将成为未来最具前景的方向之一。

提纲:

1.  环状RNA的简介以及鉴定要点

2.  环状RNA可翻译潜能预测以及主要鉴定办法

3.  Circular RNA-encoded oncogenic E-cadherin variant promotes glioblastoma tumorigenicity through activation of EGFR–STAT3 signalling

 

报告3

5′UTR 区的uORF翻译——一个依然被人忽视的金矿

内容简介:

5′UTR在翻译调控中至关重要,近半数转录本的翻译受到5′UTR区小开放阅读框(uORF)调控。但无论从研究论文的数量和深度看,这个领域的研究价值还远远没有被充分挖掘。人们通常认为, uORFs通过影响起始核糖体的移动,从而抑制或者激活主开放阅读框(mORF)的翻译。但越来越多研究表明,uORF编码的多肽可以独立于下游的mORF,行使不同的生物学功能,从而大大丰富了细胞蛋白质多样性。无论是功能多肽挖掘还是治疗靶点开发,uORF的研究才刚刚开始,这是一个令人兴奋的前沿领域。

报告主要内容:

(1)简要概述ribo-seq的应用,以及该技术对新型多肽挖掘的价值

(2) uORF在生物体内的翻译特征以及功能调控机制

(3) PTEN uORF编码的多肽MP31研究为例[3],讲解uORF编码多肽的研究思路


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