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纵观单细胞转录组的文章，都是以细胞分群和细胞亚群鉴定为起点，这是赋予细胞群体生物学意义的一步，是完成后续分析的基础。传统的细胞亚群鉴定以人工注释为主，伴随着marker基因整理、图形交互和逻辑推断等繁琐步骤，耗时耗力。近两年，有不少自动化注释软件出现，减少了细胞注释的工作量但并未得到广泛的推广。本次课程将对主流细胞注释软件进行原理介绍，并对其中的singleR软件进行详细的介绍以及如何合理利用自动化注释结果完成细胞注释。

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