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课程-单细胞转录组数据的流程分析

单细胞转录组,利用二维码序列将每一个细胞进行标记,使得最终的测序结果可以将每一条mRNA归属回本属于它的细胞中,实现单细胞级的转录组测序。通过单细胞转录组,我们可以从细胞层面解析样本的转录组变化,去探索罕见的细胞类型和微量的转录组变化,为生物学研究提供了一个独特的解析视角,在各个研究领域已经有广泛的应用。

但是,单细胞转录组在提升数据分辨率的同时,也将数据结构进行了复杂化,如何将数据进行合理的整合和归类,以适应单细胞转录组的分析需求是完成组学研究的基础。

本系列的课程围绕单细胞转录组的技术特点、软件原理、研究思路和文献案例等方面和大家交流单细胞数据流程分析经验。

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单细胞转录组,利用二维码序列将每一个细胞进行标记,使得最终的测序结果可以将每一条mRNA归属回本属于它的细胞中,实现单细胞级的转录组测序。单细胞测序技术是生物学领域的一大创举,也是生物学发展的一个必然产物。通过单细胞转录组,我们可以从细胞层面解析样本的转录组变化,去探索罕见的细胞类型和微量的转录组变化,为生物学研究提供了一个独特的解析视角,在各个研究领域已经有广泛的应用。

但是,单细胞转录组在提升数据分辨率的同时,也将数据结构进行了复杂化,如何将数据进行合理的整合和归类,以适应单细胞转录组的分析需求是完成组学研究的基础。

本系列的课程围绕单细胞转录组的技术特点、软件原理、研究思路和文献案例等方面和大家交流单细胞数据流程分析经验。由基迪奥金牌讲师周老师、L.LSeptember主讲,课程将根据需要不时更新,目前主要内容如下:

 10X单细胞转录组技术简介:基础介绍篇,课程详细介绍10x Genomics单细胞转录组测序的技术原理,及该技术在不同研究领域的应用方向和价值,助您全面理解、运用这一新技术;

 10x单细胞转录组分析内容介绍及应用解析:进阶介绍篇,对10x Genomics的分析内容和具体应用进行解析,让大家了解如何利用10x去解决面临的生物学问题;

 提升10x单细胞发文档次策略解析:介绍10x Genomics的热门研究方向、总结亮点的研究套路,解析文章案例中值得借鉴的研究思路;

 单细胞转录因子分析原理与应用案例:转录因子背景介绍、SCENIC软件进行单细胞转录因子分析的算法原理以及结合高分应用案例展示转录因子分析在异质性研究和靶基因研究中的应用思路;

 拟时分析新思维——RNA velocity介绍拟时分析的概述,RNA velocity的理论基础和计算步骤,并结合案例进行结果解读和思路分析;

 

 

 


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