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个人资料
  • 真实姓名李光军
  • 性别保密
  • 生日1983 年 11 月 9 日
  • 出生地河南省 新乡市 新乡县
  • 居住地河南省 新乡市 红旗区
  • 学历硕士
  • 公司新乡医学院
  • 职位研究生

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hyyu 2019.3.22 09:48
mebetter : 你好，首先安装install.packages("ggplot2")，然后工作表格含有“Input.number，Background.number，Term，RichFactor，Pathway，P.Value”，然后在运 ... 嗯嗯，是的，install.packages("ggplot2")，不过我用的是RStudio，直接可以在Packages那里点击ggplot2就行了， data=read.csv("H:\\KEGG.csv",header=TRUE)#这是导入数据到R里面，我习惯用csv格式，导入数据的格式有多种的，H:\\KEGG.csv是数据路径来的，你可以在数据文件的属性里查找得到，header=TRUE是指明导入的数据第一行作为表头 数据表头 ... ...
hyyu 2019.3.21 16:07
mebetter: 你好，想咨询一下你关于kegg气泡图是怎么做的？我是一个初学者，R语言也不懂，请问能不能分享一下你的步奏，非常感谢。 ...
还有呢就是可以在omicshare上的气泡图里试试看，我没试过，应该也是可以的
hyyu 2019.3.21 16:06
mebetter: 你好，想咨询一下你关于kegg气泡图是怎么做的？我是一个初学者，R语言也不懂，请问能不能分享一下你的步奏，非常感谢。 ...
先把数据准备好，安装好R语言，然后加载ggplot2包，然后跟着代码走一遍看看
hyyu 2019.3.21 16:06
mebetter: 你好，想咨询一下你关于kegg气泡图是怎么做的？我是一个初学者，R语言也不懂，请问能不能分享一下你的步奏，非常感谢。 ...
http://www.omicshare.com/forum/thread-146-1-1.html这个有教程的
hyyu 2019.3.21 16:03
mebetter : 你好，想咨询一下你关于kegg气泡图是怎么做的？我是一个初学者，R语言也不懂，请问能不能分享一下你的步奏，非常感谢。 ... 气泡图是用R语言画出来的，我用R的qplot包，a=read.csv("H:\\KEGG.csv",header=TRUE) qplot=qplot(x=Input.number/Background.number,y=X.Term,xlab="RichFactor",ylab="Pathway",data=a,colour=P.Value,size=Input.number)+   scale_colour_gradient(low="red",high="green")+labs(title = "Top 20 Pathway Enrichment")+theme_bw() qplot=qplot+theme(axis.text.y = element_tex ... ...
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