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1. 数据整理和上传
可通过“说明”和“示例文件”两处查看所需表格数据格式，按要求进行数据整理。整理好自身数据后，点击“选择文件”上传数据文件，最后点击“提交”即可。
2. 结果输出
同一页面下滑，在“结果展示”页面选择对应项目编号即可获得所绘制图形。
点击“参数修改”按钮，在“基本设置”中，可以对图形的文本样式、坐标轴系及图例相关的参数进行个性化自定义修改：
如点击文本样式展开参数面板，可以调整文字样式、字号、文字颜色/粗细/透明度、X/Y轴标题等；
点击坐标轴系展开参数面板，可以显示/隐藏网格线、外边框、轴刻度线等，还能通过关闭轴刻度自适用手动限制Y轴范围，详见说明部分；
点击图例展开参数面板，可以选择是否显示图例，以及对图例的尺寸、文字样式/颜色/字号等进行调整。
在“图形设置”中，可以对图形参数和图形颜色相关参数进行修改。
点击图形颜色展开参数面板，可以选择已有配色板（6种），或自行输入十六进制颜色码自定义所需颜色。在颜色后方可更改不透明度。
点击图形参数展开面板，在河流图种类中，可以选择单向、双向及百分比三种不同样式河流图。
在类型选项中，可选择三种不同展现样式，即波浪状、折线状和阶梯状。
因此，通过选择不同的河流图种类和河流图类型，我们一共可以呈现出9种不同的河流图表达形式。
3. 图片输出
修改好所有参数后，点击“图片下载”按钮，选择所需图片格式“svg、pdf、png”，还可以修改图形的宽度和高度，完成修改后点击图形预览可查看修改宽高后的图形，无误后点击下载图形即可将图形输出到本地。
一．功能
河流图（Stream Chart），即堆叠面积图的变形图种，主要适用于不同样本/分组之间的处理方式存在梯度变化关系的数据。通过河流图，能轻松观测到各个分类变量在不同样本/分组中随着梯度处理所产生的波动和变化趋势。
二．适用范围
适用于各类常规分子实验、生理实验、转录组、蛋白组、代谢组、宏基因组、16S等所有样本/分组存在梯度变化关系的数据（如展示不同时间处理样本中候选基因的表达量变化趋势、检测某处理下样本中物种丰度在一定时间内的变化趋势、在不同浓度梯度处理下花萼/叶片的长度……），梯度关系可以是不同时间梯度，如不同的年份、季度、月份、处理天数等，还可以为不同浓度梯度处理等等。
三．输入
文件格式：支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。
数据整理：必须带有表头（即列名）和行名；第一列为分类信息（如物种名称、蛋白名称、基因名称等）。第一行为存在梯度变化的样本或分组信息。
范例数据：
1）各菌门OTUs丰度随天数的变化：
2）当变量间数值相差较大时，建议表格按照数据量从大到小进行一个预估排序整理（如下）：
3）不同候选基因在在不同时间点的数据变化情况：
四. 重要参数说明
1. 轴刻度自适应（默认打开）
当数据中不同分类变量数值相差较大（如范例数据2中的99和0.01），此时轴刻度自适应只能看到整体变化趋势；若想要观察到极小值数据的微小变化，可通过关闭轴刻度自适应，手动限制Y轴坐标范围来放大局部所关注区间。
Y轴坐标说明：河流图Y轴数值仅为堆叠后的总数值，每个变量所对应河流条带的位置所对应的Y轴数据并无意义。因此在河流图中无法确定具体数值，而是用于观察整体的一个变化波动或者趋势。
2. 河流图种类：双向、单向、百分比
双向波浪形河流图：将位于最下层变量所代表的的河流条带围绕X轴创建对称河流，整体河流堆叠后往上平移（选择双向种类时，Y轴数据堆叠不等于总数值堆叠，因此只能用于展示变化趋势）。
单向波浪形河流图：等同于面积堆叠图，Y轴的数值等于变量数据堆叠后的总和。
百分比波浪形河流图：以百分比的形式显示每一种变量所占据的份额，Y轴范围区间为【0-1】，若限制Y轴范围，需要注意数值要在0-1内。
3. 河流图类型：波浪（默认）、折线、阶梯
双向折线型河流图
双向阶梯型河流图（等同堆叠柱形图）
五. 结果输出
在“图形下载”处选择所需图片格式（svg、png、pdf）及图形的宽度和高度，点击“图形预览”可及时查看修改宽高比后的图形效果，确定无误后点击“下载图形”即可。
结果解读：
上图为单向波浪形河流图输出结果，代表了关注的10个候选基因在21个时间梯度样本中的表达量丰度变化趋势。一个颜色条带代表一个候选基因，每个条带在不同位置的宽度（垂直长度）即代表基因表达量，两个相邻时间点间条带由宽到窄，表示基因表达量降低；条带由窄到宽，表示基因表达量升高。
Q1. 上传的数据需要保存成什么格式？文件名称和拓展名有没有要求？
OmicShare当前支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。如果是核酸、蛋白序列文件，必须为FASTA格式（本质是文本文件）。
文件名可由英文和数字构成，文件拓展名没有限制，可以是“.txt”、“.xlsx”、“.xls”、“.csv”“.fasta”等，例如 mydata01.txt，gene02.xlsx 。
Q2. 提交时报错常见问题：
1.提交时显示X行X列空行/无数据，请先自查表格中是否存在空格或空行,需要删掉。
2.提交时显示列数只有1列，但表格数据不止1列：列间需要用分隔符隔开，先行检查文件是否用了分隔符。
其它提示报错，请先自行根据提示修改；如果仍然无法提交，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
Q3. 提交的任务完成后却不出图该怎么办？
主要原因是上传的数据文件存在特殊符号所致。可参考以下建议逐一排查出错原因：
（1）数据中含中文字符，把中文改成英文；
（2） 数据中含特殊符号，例如 %、NA、+、-、（）、空格、科学计数、罗马字母等，去掉特殊符号，将空值用数字“0”替换；
（3）检查数据中是否有空列、空行、重复的行、重复的列，特别是行名（一般为gene id）、列名(一般为样本名)出现重复值，如果有删掉。
排查完之后，重新上传数据、提交任务。如果仍然不出图，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
Q4.下载的结果文件用什么软件打开？
OmicShare云平台的结果文件（例如，下图为KEGG富集分析的结果文件）包括两种类型：图片文件和文本文件。
图片文件：
为了便于用户对图片进行后期编辑，OmicShare同时提供位图（png）和矢量图(pdf、svg)两种类型的图片。对于矢量图，最常见的是pdf和svg格式，常用Ai(Adobe illustrator)等进行编辑。其中，svg格式的图片可用网页浏览器打开，也可直接在word、ppt中使用。
文本文件：
文本文件的拓展名主要有4种类型：“.os”、“.xls”、“.log”和“.txt”。这些文件本质上都是制表符分隔的文本文件，使用记事本、Notepad++、EditPlus、Excel等文本编辑器直接打开即可。结果文件中，拓展名为“.os”文件为上传的原始数据；“.xls”文件一般为分析生成的数据表格；“.log”文件为任务运行日志文件，便于检查任务出错原因。
Q5. 提交的任务一直在排队怎么办？
提交任务后都需要排队，1分钟后，点击“任务状态刷新”按钮即可。除了可能需运行数天的注释工具，一般工具数十秒即可出结果，如果超出30分钟仍无结果，请联系OS客服，发送任务编号给OmicShare客服，会有专人为你处理任务问题。
Q6. 结果页面窗口有问题，图表加载不出来怎么办？
尝试用谷歌浏览器登录OmicShare查看结果文件，部分浏览器可能不兼容。