动态泡泡图


*
选择文件 示例文件
*ProVIP免费
*VIP免费
*当前账户剩余0次

 

下载示例文件,点击选择文件按钮,上传范例数据,然后提交任务。

 

 

在左侧导航栏中点击我的项目查看任务进度,任务完成后点击跳转查看按钮进入图形预览调整窗口。

 

 

初始得到的绘图效果如下:

 

 

图形设置选项中,可以将气泡的排序方式设置为不排序,效果如下。

 

 

当然,也可以改变气泡大小与表格数值的映射方式,比如将半径改为面积,这样,气泡的大小更均匀一些。

 

 

接下来,我们也可以自定义指定或修改不同分组气泡的颜色,如下。

 

 

甚至,还可以修改气泡的描边粗细和描边颜色,例如,我这里将气泡的描边颜色设置为白色。

 

 

完成调整后,在下载选项窗口中,可指定图形的宽高比例(这里调整为450400),点击图形预览按钮可查看更改后的效果。OmicShare支持3种格式(SVGPDFPNG)图片的保存,点击下载图形按钮将调整后的图形保存到本地。

 

 

最终下载得到的图片如下:

 

 

 

 

1.功能

泡泡图,可以看作一种没有坐标轴的“柱状图”,不同的泡泡对应不同的柱子,泡泡的大小对应柱子的高度,是一种比较新颖数据可视化方式!

 

 

2.应用范围

不管是组学数据,还是常规实验数据都适合,当样本或分组比较多时可以试试泡泡图!

 

3.输入文件

上传文件必须严格按照示例文件的格式进行整理,范例数据的表格至少需要2列(最多不超过10列),第2列(最后一列)必须为数值型,对应气泡的大小,第1列(前几列)数据为字符型对应分类标签,如下图。

 

 

 

4.结果输出

生成动态泡泡图,可通过设置选项对图形进行个性化调整,比如修改气泡的排序方式、气泡颜色、图形比例等。

 

 

当然,也可以改变气泡大小与表格数值的映射方式,比如将半径改为面积,这样,气泡的大小更均匀一些。

 

Q1. 上传的数据需要保存成什么格式?文件名称和拓展名有没有要求?

 

OmicShare当前支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式,同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。如果是核酸、蛋白序列文件,必须为FASTA格式(本质是文本文件)。

 

文件名可由英文和数字构成,文件拓展名没有限制,可以是“.txt”、“.xlsx”、“.xls”、“.csv”“.fasta”等,例如 mydata01.txt,gene02.xlsx 。

 

Q2. 提交时报错常见问题:

 

1.提交时显示X行X列空行/无数据,请先自查表格中是否存在空格或空行,需要删掉。

2.提交时显示列数只有1列,但表格数据不止1列:列间需要用分隔符隔开,先行检查文件是否用了分隔符。

其它提示报错,请先自行根据提示修改;如果仍然无法提交,可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。

 

Q3. 提交的任务完成后却不出图该怎么办?

 

主要原因是上传的数据文件存在特殊符号所致。可参考以下建议逐一排查出错原因:
(1)数据中含中文字符,把中文改成英文;
(2) 数据中含特殊符号,例如 %、NA、+、-、()、空格、科学计数、罗马字母等,去掉特殊符号,将空值用数字“0”替换;
(3)检查数据中是否有空列、空行、重复的行、重复的列,特别是行名(一般为gene id)、列名(一般为样本名)出现重复值,如果有删掉。
排查完之后,重新上传数据、提交任务。如果仍然不出图,可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。

 

Q4.下载的结果文件用什么软件打开?

 

OmicShare云平台的结果文件(例如,下图为KEGG富集分析的结果文件)包括两种类型:图片文件和文本文件。

图片文件:

为了便于用户对图片进行后期编辑,OmicShare同时提供位图(png)和矢量图(pdf、svg)两种类型的图片。对于矢量图,最常见的是pdf和svg格式,常用Ai(Adobe illustrator)等进行编辑。其中,svg格式的图片可用网页浏览器打开,也可直接在word、ppt中使用。

 

文本文件:

文本文件的拓展名主要有4种类型:“.os”、“.xls”、“.log”和“.txt”。这些文件本质上都是制表符分隔的文本文件,使用记事本、Notepad++、EditPlus、Excel等文本编辑器直接打开即可。结果文件中,拓展名为“.os”文件为上传的原始数据;“.xls”文件一般为分析生成的数据表格;“.log”文件为任务运行日志文件,便于检查任务出错原因。

 

Q5. 提交的任务一直在排队怎么办?

 

提交任务后都需要排队,1分钟后,点击“任务状态刷新”按钮即可。除了可能需运行数天的注释工具,一般工具数十秒即可出结果,如果超出30分钟仍无结果,请联系OS客服,发送任务编号给OmicShare客服,会有专人为你处理任务问题。

 

Q6. 结果页面窗口有问题,图表加载不出来怎么办?

尝试用谷歌浏览器登录OmicShare查看结果文件,部分浏览器可能不兼容。

结果展示