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1. 功能
帮助用户解决常见研究物种的基因ID在不同数据库之间的ID转换，并且提供基因的常见注释信息，为用户研究基因提供方便。
2. 适用物种
拟南芥（Arabidopsis thaliana）、牛（Bos taurus）、山羊（Capra hircus）、秀丽线虫（Caenorhabditis elegans）、果蝇（Drosophila melanogaster）、斑马鱼（danio rerio）、鸡（gallus gallus）、人（homo sapiens）、猕猴（Macaca mulatta）、小鼠（mus musculus）、籼稻（oryza indica）、水稻（oryza sativa）、大鼠（rattus norvegicus）、酵母（Saccharomyces cerevisiae）、番茄（Solanum lycopersicum）、猪（Sus scrofa）、小麦（Triticum aestivum）、玉米（Zea mays）
3. 输入
文件格式：支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。
数据格式：一行一个基因ID，以Ensembl Gene ID为例，格式如下：
4. 参数选项
输入文件是否有列名：根据输入文件选择是/否
物种选择：选择输入ID的物种类型
输入ID类型：选择要转换的ID类型，默认可读取4种类型之一，分别是 Gene_stable_ID (Ensembl gene ID) / Gene_name (Gene Symbol) / NCBI_gene_ID (NCBI Entrez Gene ID) / Gene_Synonym
注：4种ID类型的示例文件可点击输入文件旁边的“示例文件”查看
输出ID类型：可选择输出多种ID类型，或者选择输出多种数据库的基因功能注释信息，帮助快速了解该基因功能信息，自行勾选所需即可。
5. 输出文件
xls格式文件
示例文件：小鼠的ensembl ID
1. 参数设置
2. 输出文件
第一列：用户输入的ID，symbol 号
第二列：小鼠的ensembl ID
第三列：NCBI ID号，通常是数值
第四列：基因同义名
第五列：基因的注释信息，如基因功能，表达某蛋白
第六列：KEGG A分类，一般有7大类
第七列：KEGG B分类，比A分类的信息更详细
第八列：通路ID，即ko号，还有通路详细名称，如TGFβ信号通路
第九列：K号，可用与KEGG富集分析
第十列：GO注释细胞组分
第十一列：GO注释分子功能
第十二列：GO注释生物学途径
Q1. 为什么输出没有结果，如下图？
没有输出结果可能原因：
①物种选错了；
②上传的文件中，基因ID类型跟参数选择不对应。
Q2. 为什么输出结果，数目比我提交时多？
比如 一个NCBI_gene_ID可能对应多个Gene Synonym（如:3804对应Gene Synonym有CD158B2、p58、NKAT2），工具会把所有结果输出。
Q3：为什么有部分基因没有结果？
如果有部分基因没有数据，有可能是该基因类型选错了。
比如下图中"CD89""103AS"类型是Gene_Synonym，在分析时选了”Gene_name“则比对不上，无结果了。
Q4. 提交时报错常见问题：
1.提交时显示X行X列空行/无数据，请先自查表格中是否存在空格或空行,需要删掉。
2.提交时显示列数只有1列，但表格数据不止1列：列间需要用分隔符隔开，先行检查文件是否用了分隔符。
其它提示报错，请先自行根据提示修改；如果仍然无法提交，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
Q3. 提交的任务完成后却不出图该怎么办？
主要原因是上传的数据文件存在特殊符号所致。可参考以下建议逐一排查出错原因：
（1）数据中含中文字符，把中文改成英文；
（2） 数据中含特殊符号，例如 %、NA、+、-、（）、空格、科学计数、罗马字母等，去掉特殊符号，将空值用数字“0”替换；
（3）检查数据中是否有空列、空行、重复的行、重复的列，特别是行名（一般为gene id）、列名(一般为样本名)出现重复值，如果有删掉。
排查完之后，重新上传数据、提交任务。如果仍然不出图，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
引用OmicShare Tools的参考文献为：
Mu, Hongyan, Jianzhou Chen, Wenjie Huang, Gui Huang, Meiying Deng, Shimiao Hong, Peng Ai, Chuan Gao, and Huangkai Zhou. 2024. “OmicShare tools: a Zero‐Code Interactive Online Platform for Biological Data Analysis and Visualization.” iMeta e228. https://doi.org/10.1002/imt2.228案例1：
发表期刊：Journal of Hainan Medical College
发表时间：2020
引用方式：
“to obtain the Gene ID of the target, and then convert it into the Ensembl Gene ID through the Ensembl genome database, and import it into the OmicShare cloud platform“
参考文献：
Zhou M Q, Yang L P, Ma H J, et al. Network pharmacological study of Qingfei Paidu Decoction intervening on cytokine storm mechanism of COVID-19[J]. Journal of Hainan Medical College, 2020, 26(10).