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CAZy数据库功能注释简介
CAZy 全称为Carbohydrate-Active enZYmes Database，是碳水化合物酶相关的专业数据库，包括催化碳水化合物和糖复合物的生物合成、降解以及修饰的相关酶系家族，根据蛋白质结构域中氨基酸序列的相似性，划分为5个类别：糖苷水解酶（Glycoside Hydrolases, GHs）、糖基转移酶（Glycosyl Transferases, GTs）、多糖裂解酶（Polysaccharide Lyases, PLs）、碳水化合物酯酶（Carbohydrate Esterases, CEs），碳水化合物辅助酶类（Auxiliary Activities，AAs），以及1个模块：碳水化合物结合结构域（Carbohydrate-Binding Modules，CBMs）。
使用DIAMOND默认参数将目标序列CAZy数据库比对。
输入文件
上传fasta格式的核酸或蛋白query序列文件。
结果
1. 注释结果
1）注释总表
2）A级分类统计（5个类别和1个模块）
3）B级分类统计（各类别子分类的基因列表）
2. CAZy各类别注释结果统计
对5个类别和1个模块的注释结果统计并画柱形图。
3.比对结果统计饼图
（1）将比对上的与比对不上的序列数目进行统计并画饼图。
（2）E值分布统计
1. 注释结果
1）注释总表
表头解释：
Query_id ：输入序列的编号
Query_length:输入序列的长度
Query_start ：比对上的部分在query序列上的起始位置
Query _end ：比对上的部分在query序列上的终止位置
Subject_id ：比对到数据库中序列编号
Subject_length：数据库中比对上的序列的长度
Subject_start：比对上的部分在数据库序列上的起始位置
Subject_end：比对上的部分在数据库序列上的终止位置
Identity(%) ：比对的相似性（百分比）
Positive：匹配上的碱基或氨基酸数目
Gap：Gap 的数目
Align_length：匹配部分的长度
Score：比对的打分（打分越高，可信度越高）
E_value ： 比对的 E值（E值越小，可信度越高）
Subject_annotation :CAZy数据库分类名称
2）A级分类统计（5个类别和1个模块）
对5个类别和1个模块的注释结果统计。
Class: 数据库中的分类缩写
Calss name:数据库中的分类名称
Count：注释为该分类的序列数量
3）B级分类统计（各类别子分类的基因列表）
2. CAZy各类别注释结果统计
对5个类别和1个模块的注释结果统计绘图如下：
3.比对结果统计饼图
（1）将比对上的与比对不上的序列数目进行统计并画饼图。
（2）E值分布统计
E值是指期望数据库中具有某一统计学意义配对序列的值，可理解为比对的假阳性率。E值越小，结果越可靠。对E值分为5个范围进行统计，并画饼图。
Q1. 上传的数据需要保存成什么格式？文件名称和拓展名有没有要求？
OmicShare当前支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。如果是核酸、蛋白序列文件，必须为FASTA格式（本质是文本文件）。
文件名可由英文和数字构成，文件拓展名没有限制，可以是“.txt”、“.xlsx”、“.xls”、“.csv”“.fasta”等，例如 mydata01.txt，gene02.xlsx 。
Q2.注释工具的任务一般要跑多久？
注释工具的任务时长一般与提交的序列条数成正比，且不同工具耗时也差异很大。例如GO功能注释近一年来所有任务平均时长约为2天，而NR注释工具近一年来所有任务平均时长约为3小时。一般情况下，如果任务耗时超出一周可联系OS客服，发送任务编号给OmicShare客服，会有专人为你处理任务问题。