楼主: 小圆

第19期在线交流cytoscape介绍与实操【视频】

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    发表于 2016.6.25 11:22:12 来自手机 | 显示全部楼层
    顶帖。一定火
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    发表于 2016.6.28 21:14:40 | 显示全部楼层
    小菜鸟还在找视频。。。。谁能提示我一下,在哪里?
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     楼主| 发表于 2016.6.29 09:14:17 | 显示全部楼层
    sunshine-girl 发表于 2016.6.28 21:14
    小菜鸟还在找视频。。。。谁能提示我一下,在哪里?

    在沙发 板凳那两层
    事在人为~
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    发表于 2016.7.3 15:06:53 | 显示全部楼层
    老师 ,我的pp那个没有实现。还有一个问题是这个相互作用的关系文件是大家公认的一个公共文件吧,谢谢
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    发表于 2016.7.3 15:08:07 | 显示全部楼层
    笑嘻嘻笑嘻嘻笑嘻嘻笑嘻
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    发表于 2016.7.13 11:36:48 | 显示全部楼层
    请问视频在哪呀 没找到
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    发表于 2016.7.13 14:22:25 | 显示全部楼层
    Anna 发表于 2016.7.13 11:36
    请问视频在哪呀 没找到

    2、3、4楼
    有问题请发贴提问
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  • TA的每日心情

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    发表于 2016.7.15 17:59:28 | 显示全部楼层
    学到了好多新的知识
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    发表于 2016.7.16 17:15:03 | 显示全部楼层

    谢谢。看了视频,学到了很多,很感谢。
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    发表于 2016.7.22 22:37:31 | 显示全部楼层
    老师,非常感谢您的讲解,我有个问题,我从STRING蛋白质互作数据库(http://string-db.org/)中的互作关系, 我首先将目 标基因集序列应用blastx(evalue设为1e-10)比对到string数据库中包含的参考物种蛋白质序列上, 并利用参考物种的蛋白质互作关系构建互作网络。输出一一对应的tab格式,参考物种是拟南芥,我的小麦,然后,按照视频将的做,结果很奇怪,我想问的是,这个软件不需要选择一下物种吗?我刚打开软件的时候,好像看到有拟南芥的物种的名字。
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    发表于 2016.7.23 01:20:09 | 显示全部楼层
    LTJ 发表于 2016.7.3 15:06
    老师 ,我的pp那个没有实现。还有一个问题是这个相互作用的关系文件是大家公认的一个公共文件吧,谢谢 ...

    不一定,绘图文件可以来自数据库的下载,也可以从你自己的数据中进行生物信息分析而得到。
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    发表于 2016.7.23 01:21:19 | 显示全部楼层
    下一转角5210 发表于 2016.7.22 22:37
    老师,非常感谢您的讲解,我有个问题,我从STRING蛋白质互作数据库(http://string-db.org/)中的互作关系,  ...

    不需要选择物种。但这个软件在线预存储了某些物种的基因互作关系,例如拟南芥。如果你研究拟南芥,则可以直接下载使用。
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    发表于 2016.7.28 08:33:54 | 显示全部楼层
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    发表于 2016.7.28 17:01:00 | 显示全部楼层
    学习了!请问是否能实现对一个gene list在已知互作网络中判断是否为关键节点?谢谢啦~~
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    2016.12.30 22:15
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    发表于 2016.7.29 13:36:35 | 显示全部楼层
    今晚可以来此灌水
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    灌水之王


    发表于 2016.8.6 15:38:18 | 显示全部楼层
    好东西。点赞。
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    2016.9.26 11:26
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    发表于 2016.8.11 12:18:38 | 显示全部楼层
    哇!!!!!大爱!!!!学习了!!!!
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    2018.1.22 00:54
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    发表于 2016.8.26 19:41:09 | 显示全部楼层
    太给力了
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  • TA的每日心情

    2016.8.27 17:57
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    发表于 2016.8.26 22:25:36 | 显示全部楼层
    楼主棒棒哒
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  • TA的每日心情

    2016.9.1 16:27
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    发表于 2016.9.1 16:26:05 | 显示全部楼层
    太赞了,给力!
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