早在2015年,Kenneth D. Birnbaum团队便借助融合荧光蛋白技术,特异性挑选了基础中心细胞(quiescent center, QC)细胞和中柱细胞用于CEL-seq分析,将单细胞测序与转录组测序联合分析,以细胞同一性指数(index of cell identity, ICI)进行细胞分群,首次在植物组织中完成了单细胞水平的标记基因筛选,挖掘出了新的QC细胞、中柱细胞、生毛细胞的标记基因,为后续的植物单细胞研究提供了一定的基础。
得益于SMART-seq2和 CEL-seq2技术对组织单细胞的高分辨率,Kenneth D. Birnbaum团队和Brad Nelms团队分别在《Cell》和《Science》发表文章,完成了对愈伤组织和性母细胞的分化研究。高精度的单细胞测序捕捉到了愈伤组织和性母细胞在进入分化阶段前的瞬息变化,打破了传统转录组的限制,这很大程度推进了植物细胞图谱的精细研究。