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【直播开讲】利用图表交互动态实现sRNA数据挖掘

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迅猛龙

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发表于 2021.4.29 09:14:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
从1993年在秀丽线虫体中发现首条miRNA,到如今在各类生物体中均发现miRNA的身影,已走过近30年的时间。这30年中,人们对miRNA研究的不断深入,更多的miRNA被发掘出来,同时miRNA介导的生物学调控机制也更清晰明朗。先前研究发现,miRNA可通过对mRNA的靶向调节,以调控个体发育、细胞增殖分化肿瘤的发生发展等过程,miRNA还可与lncRNA结合以降低其对靶基因的翻译抑制或降解作用。

围绕miRNA的分析主要有五部分:miRNA鉴定、miRNA差异表达、miRNA靶基因预测,靶基因富集分析、miRNA---靶基因网络图,根据miRNA可能调控的靶基因,及靶基因显著富集的通路信息,推测miRNA潜在的调控机制。在数据挖掘时,理论表述告诉你“你懂得这些分析”!但实战分析操作告诉你“你不会”!很多老师在翻过了实验设计的“大山”时,却停滞在数据挖掘部分,生信分析门槛较高,其他软件又要各种数据转换,常常在一个分析点上就已身心俱疲,何谈之后的“漫漫分析路”。

话说,“工欲善其事必先利其器”,基迪奥在Omicsmart平台上正式推出“sRNA在线报告”,提供了完整的在线分析流程,帮助用户轻松完成数据挖掘和图形可视化过程。尤其对于需要个性化调整的老师(阈值调整、目标基因集调整、目标基因集分析、图形在线修改等),可在线实现个性化调整,完成各项补充分析。

本报告主要涵盖三个部分:

全面详细的分析内容
分析内容涵盖miRNA鉴定,miRNA靶基因预测、miRN靶基因网络图、以及目标miRNA和目标靶基因的富集分析等,帮助用户筛选目标miRNA和预测miRNA调控的靶基因,或通过目标miRNA趋势分析,了解miRNA变化趋势并寻找显著富集的变化趋势;

动态交互的数据探索
用户可根据需求对数据进行绘图,部分分析点可调整绘图参数,同时提供不同的展示形式,也可按照需求勾选目标数据绘制图形,便于高效进行数据挖掘探索;

个性高效的图形美化
可对图形的点、线、配色等进行调整,如对特定点添加标注,用不同颜色、大小的点或线标注目标数据,让图形数据更美观,更直观。便于利用数据挖掘结果生成期刊所需的图形。

为了让老师们更快了解Omicsmart smallRNA在线报告,并完成数据分析过程,本周四(4月29日)下午15:00直播交流,用实际案例为大家介绍miRNA数据挖掘思路,并重现文章经典图片,实现small RNA在线报告的数据挖掘过程,欢迎大家前来围观~

直播时间:2021年4月29日 15:00-16:00

直播地点:B站
B站号:基迪奥生物
房间号:22356503


Omicsmart smallRNA在线报告地址:
https://www.omicsmart.com/home.html#/mir

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迅猛龙

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迅猛龙

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迅猛龙

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