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推荐一波美图实时绘制小工具

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帝王蝶

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发表于 2020.8.7 09:27:29 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 基迪奥-Jt桃 于 2020.8.7 09:26 编辑

高质量数据展示图是高分期刊的“标配”,在这个看 “颜值”又重“内在”的科研世界观里,如果说实验设计决定了一个研究课题的下限,那数据作图能力的强弱就决定了课题的上限。

图形的参数修改、调整等步骤耗时耗力,为了能让广大科研小伙伴摆脱烦恼、突破上限、发表高分文章、走上人生巅峰,基迪奥生物Omicshare平台在这个暑期8月重磅推出科研作图神器-动态交互图形工具合集,一周一系列作图神器,用完你就是科研界的“后浪”!开通OS会员,即刻赠送1000奥币,任性使用所有动态工具。

基迪奥动态工具VS传统静态工具

这些高颜值动态工具上线:



工具特点

高自由度操作:摒弃过去先填写参数再输出图形模式,对图形中任意参数都可以实时调整。

多参数交互:图形可以调整字体、配色、标题、辅助线等20+参数,出图后不满意随时调整。

随时预览、下载:可根据需求调整图片整体大小,提供SVG、png格式下载。

工具介绍

1.热图系列—动态热图、相关性热图、组间相关热图

工具网址:www.omicshare.com/tools

热图是各类组学数据最常见的展示图形之一,本次推出的三款动态热图工具除了常规参数调整外,还丰富了:
1)聚类类型(可选行、列以及同时聚类)。
2)数据归一化功能(Z-score法归一化),让热图的信息量进一步细化。
3)实现自由调整图例精度、刻度数量以及图例高度等参数,满足对图形细节的极致追求。


参考与模仿是科研的第一步,高分文章中图形一般是科研大牛们反复调整过的,这些图形的样式有许多值得我们借鉴的地方,不妨参考一些高分期刊的图形样式,以我们的动态工具进行样式重现,站在巨人的肩膀做科研!

以相关性热图为例,基迪奥合作客户今年在gut Microbes(IF=7.82)上发表的微生物领域的高分文章(参考往期文章:《基迪奥合作客户发宏基因组8分文章!》)中就有一个经典的相关性热图,采用新款相关性热图动态工具即可轻松重现该热图样式。

高分文章中的相关热图[1]

调整方格配色、增加行列聚类

增加P值标记、调整图例

2.小提琴图系列—样本小提琴图、分组小提琴图

工具网址:www.omicshare.com/tools

小提琴图反映在特定范围内数据分布状态与密度情况,当前主流文章中小提琴图有着多种展示形式,本次推出的小提琴图囊括了各类组合小提琴图:
1)散点分布展示:将数据转化为点的形式结合小提琴图曲线展示数据分布。
2)中位数+小提琴图:以中位数作为参考点结合小提琴图展示数据分布特征。
3)盒型图+小提琴图:将盒型图与小提琴图结合,展示数据的整体分布外还可以分析具体的分布指标(中位数、3/4位数和1/4位数)以及异常值的分布情况。

一键切换、一键调整,再也不用为找绘图脚本而烦恼了!


3.盒型图系列-样本盒型图、分组盒型图

工具网址:www.omicshare.com/tools

盒型图是最朴实无华的数据分布展示工具。本次推出的盒型图工具,在图形的每个细节处进行了打磨与升级,如离散点的样式、横坐标的文字角度、坐标轴的范围,都可以自由地调整,直到满意为止。


4.折线图

工具网址:www.omicshare.com/tools

折线图是反应数据动态变化的一类图形,本次推出的动态折线图也准备了充足的参数,应对各类个性化需求,可自由调整边框、折线、辅助线等参数,鼠标放置在对应点上可显示对应数据信息,真正意义上的精益求精。


5.柱状图

工具网址:www.omicshare.com/tools

柱状图是科研文章中最常见的图形,本次推出的新款动态柱状图,设计了分组、样本两个展示角度,将各类需要用到的细节参数全部配置(标题、柱子宽度、文字角度、数值、图例…),一次性调整所有需要的参数,即刻下载,节省时间成本。


如何使用

注册基迪奥omicshare用户即可。所有注册用户可免费使用两次动态工具。
如果你已经是omicshare的会员,那么此次升级后,你将获得2000奥币到账,可以任性使用工具。
如果你现在充值omicshare会员,也将免费获得1000奥币,可以肆意使用工具。

注:1元=10奥币

会员特权详情

升级OS会员,体验一站式科研服务。下周将推出6款降维类动态工具,敬请期待~

参考文献:
[1] Zhou Dan, Xuhua Mao, Qisha Liu, Mengchen Guo, Yaoyao Zhuang, Zhi Liu, Kun Chen, Junyu Chen, Rui Xu, Junming Tang, Lianhong Qin, Bing Gu, Kangjian Liu, Chuan Su, Faming Zhang, Yankai Xia, Zhibin Hu & Xingyin Liu (2020): Altered gut microbial profile is associated with abnormal metabolism activity of Autism Spectrum Disorder, Gut Microbes, DOI: 10.1080/19490976.2020.1747329.

本文作者:基迪奥-阿拉雷
               


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