真菌侵染植物转录组如何分析？

daipengbo1988 · 发表于 2019.10.29 08:26:57

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大神们好，实验室测了果实病原真菌侵染苹果的转录组，除了分析差异表达基因外，找到了上调和下调的基因，进一步如何分析？

求指点》

daipengbo1988 · 发表于 2019.10.29 08:28:19

自己顶一下

daipengbo1988 · 发表于 2019.10.30 20:05:41

桑心ing

xusq · 发表于 2019.10.30 23:41:48

最简单的教程就是看文献，类似文献怎么分析

daipengbo1988 · 发表于 2019.11.1 08:23:09

xusq 发表于 2019.10.30 23:41
最简单的教程就是看文献，类似文献怎么分析

谢谢，高分影响因子的文章原理，做什么讲得少，说结果和基因自己试验的分析多。

xusq · 发表于 2019.11.2 22:26:34

daipengbo1988 发表于 2019.11.1 08:23
谢谢，高分影响因子的文章原理，做什么讲得少，说结果和基因自己试验的分析多。 ...

侵染是一个过程，有时间进程，这个看你的基础了，如果你的显微镜用的好，孢子萌发形成芽管时间确定之后分几个时间段取样；侵染前期看不到症状，可以用GFP荧光确定接种接上了，至于分析都是流程化的了，把侵染后植物和真菌都分析了，筛选到你感兴趣的就是做验证了。总之就是多看文献。

daipengbo1988 · 发表于 2019.11.3 16:18:32

xusq 发表于 2019.11.2 22:26
侵染是一个过程，有时间进程，这个看你的基础了，如果你的显微镜用的好，孢子萌发形成芽管时间确定之后分 ...

感谢感谢，总感觉你是植物病理学专业的。

xusq · 发表于 2019.11.5 10:34:11

daipengbo1988 发表于 2019.11.3 16:18
感谢感谢，总感觉你是植物病理学专业的。

有一部分工作跟病理相关。