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[lncRNA] lncRNA测序研究思路不只1条!

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  • TA的每日心情

    2017.11.10 13:58
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    发表于 2016.4.24 21:06:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
    非编码RNA(non-coding RNA)是近年来发展非常迅速的领域,其中长链非编码RNA(long non-coding RNA)更是被科研人员热烈追捧和探讨的明星ncRNA分子。


    由于lncRNA作用方式的多样化,因此其功能的研究往往要结合其他组学的数据(例如mRNA、miRNA的表达量信息)来进行研究。广州基迪奥lncRNA测序采取去除rRNA的策略,可以同时检测样本中的lncRNA和mRNA表达量,不仅可以鉴定特异表达的lncRNA和发现新lncRNA,更可开展后续关联性分析,深入挖掘基因调控机制,广泛应用于发育调控、 疾病标记物的寻找、药物靶点筛选等领域。



    思路不止一个!作为一家以定制化生物信息分析见长的公司,基迪奥的技术支持们将根据项目的不同研究目的、样本特点量身定制方案,结合最佳的分析手段,深入挖掘项目数据和解读数据背后的生物学意义,提供专业个性化分析服务。

    产品优势:

    1、数据信息量大:一次测序可同时得到mRNA转录本相关信息,可进行lncRNA-mRNA关联分析、构建lncRNA-mRNA共表达网络,让研究更全面更深入;
    2、比芯片分析更全面:不仅能鉴定已知lncRNA,还能预测和分析新lncRNA,检测出样本中几乎全部转录本;并且对于非模式生物,无需额外定制化芯片,让研究更快速。

    你们关心的图片来了:

    案例:

    lncRNA和增强子RNA(enhancer RNAs)调控细菌脂多糖诱导的人单核细胞炎症反应

    lncRNA在人类先天免疫应答中的作用还未见报道。2014年牛津大学的研究人员利用lncRNA-seq研究了人主要单核细胞受细菌脂多糖应激后lncRNA的表达变化。通过差异表达分析和位置关系分析,找到了两条与脂多糖刺激后表达量第二高的炎症介质因子IL1β相邻(距离 < 5k)的候选lncRNA,这两条lncRNA一条为双向转录本RBT(IL1β-RBT46),一条为enhancer RNA(IL1β-eRNA)。并通过knockdown实验验证了两条lncRNA可调控IL1β和CXCL8的表达。


    文章研究思路:


    参考文献:
    [1] Lee J H, Gao C, Peng G, et al. Analysis oftranscriptome complexity through RNA sequencing in normal and failing murinehearts[J]. Circulation research, 2011, 109(12): 1332-1341.

    [2] IIott N E, Heward J A, Roux B, et al. Longnon-coding RNAs and enhancer RNAs regulate the lipopolysaccharide-inducedinflammatory response in human monocytes[J]. Nature communications, 2014, 5.

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    发表于 2016.4.27 17:05:02 | 显示全部楼层
    谢谢!学习了
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  • TA的每日心情
    好棒
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    发表于 2020.5.7 09:57:15 | 显示全部楼层
    涨知识了
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    灌水之王


    发表于 2020.5.15 09:29:06 | 显示全部楼层
    新的一天加油!
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