染色体和位置打乱得vcf文件排序

大裤衩 · 发表于 2019.1.23 20:04:35

如题，文件前几列如图

Wuii · 发表于 2019.1.24 08:33:50

问题不明确，直接保存header ,随后将剩余信息全部保存到内存中，进行一次高级排序，输出，可以了。如果未见极其大，考虑归并排序

platove · 发表于 2019.1.24 10:23:03

sort -k

大裤衩 · 发表于 2019.1.24 11:06:49

platove 发表于 2019.1.24 10:23
sort -k

脑子一时间不转了，

，后来vcftools可以直接排

platove · 发表于 2019.1.24 11:21:56

大裤衩发表于 2019.1.24 11:06
脑子一时间不转了，，后来vcftools可以直接排

[Perl语言] 染色体和位置打乱得vcf文件排序