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[Perl语言] 染色体和位置打乱得vcf文件排序

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中华鲟

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发表于 2019.1.23 20:04:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
如题,文件前几列如图

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突出贡献优秀版主论坛元老


发表于 2019.1.24 08:33:50 | 显示全部楼层
问题不明确,直接保存header ,随后将剩余信息全部保存到 内存中,进行一次高级排序,输出,可以了。如果未见极其大,考虑归并排序
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功夫熊猫

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发表于 2019.1.24 10:23:03 | 显示全部楼层
sort -k
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中华鲟

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 楼主| 发表于 2019.1.24 11:06:49 | 显示全部楼层

脑子一时间不转了,,后来vcftools可以直接排
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功夫熊猫

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发表于 2019.1.24 11:21:56 | 显示全部楼层
大裤衩 发表于 2019.1.24 11:06
脑子一时间不转了,,后来vcftools可以直接排

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