代谢组学到底是个啥？

小瑶 · 发表于 2016.3.17 17:50:32

老朋友都知道，基迪奥做基因组学与蛋白组学服务多一点，但是实际情况是，在我们搞生物学研究的时候，一种组学并不能完美的解决我们的问题。所以我们也常常建议老师，用多组学贯穿分析来做研究。

代谢组学的定义

代谢组学毫无疑问是研究代谢物的。理论上代谢物应包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子代谢物质。但为了有别于基因组、转录组和蛋白质组，代谢组目前只涉及相对分子质量约小于1000的小分子代谢物质。

与基因组，转录组相比，蛋白质组学的数据更加侧重于生理学水平。能够快准狠的反映生物体的病理生理状态。

在2010年前，代谢组学的研究的主要瓶颈是用于鉴定的代谢物种类较少，只在100种以内。但是现在研究种类到300+了，并且还在不断增加。而代谢组学相关的研究也蛮热的，如上图图，在pubmed上的数据显示，代谢组的文章上升趋势还是很明显滴。

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。其一称作代谢物指纹分析，采用液相色谱-质谱联用的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。另一种是代谢轮廓分析，研究人员假定了一条特定的代谢途径，并对此进行更深入的研究。

与转录组研究一样，代谢组学研究的难度不在于数据生成，而是数据分析。这也是我们存在的意义有木有~

代谢组学的数据分析思路

1.描述检测代谢物种类

2.PCA组成分分析确定代谢物在相同分组中的稳定性（即组内重复性和组间差异性）

3.筛选差异代谢物；

4.差异代谢物所分布的信号转导通路（PATHWAY）；

5.差异代谢物随时间或大于阶段的变化规律分析；

6.分子标志物筛选。当然，根据不同实验目的，还有特殊的分析模式。

随着基因组学、转录组学的发展，联合代谢物进行分析已经成为流行趋势，不仅从现象中检测出差异的代谢物，更从基因层面解释了代谢物变化的原因，反映基因层面变化，导致的代谢物变化，发高逼格的文章……(低分的文章讲的是某种生物学现象的表现研究，高分的文章则是背后的逻辑关系、机理的研究。)

我们也解读了基因组学与代谢组贯穿研究的seminar，感兴趣的同学可以戳下面的链接看：

有解读PPT可下载哟~

guanzi · 发表于 2016.3.23 16:18:33

496071151 · 发表于 2016.3.23 23:44:43

不错啊，这个不错

小瑶 · 发表于 2016.3.24 09:06:10

496071151 发表于 2016.3.23 23:44
不错啊，这个不错

有用就好~

hfaslan · 发表于 2016.4.21 16:18:50

我倾向多组学

XMU-WXW · 发表于 2016.5.10 16:50:20

我目前把想要做的转录组学，蛋白组学，代谢组学的东西结合起来，但是确实无从下手！代谢组学除了PCA分析，还有别的分析方法了么？我的代谢组学主要做的脂代谢！四种大分子物质做了3种，就差糖代谢没去分析了！~但是感觉前路茫茫啊！

yuanyi · 发表于 2016.6.14 20:33:23

支持了

luoxiaochen · 发表于 2016.10.25 14:16:05

Lizhenshuang · 发表于 2019.11.2 10:37:10

daipengbo1988 · 发表于 2019.11.21 07:50:29

感谢楼主分享

崔俊丽 · 发表于 2020.5.11 09:39:51

涨知识了

给祖国添麻烦了 · 发表于 2020.5.11 10:48:42

zhouhang · 发表于 2021.2.1 20:00:03

2012csc · 发表于 2021.3.2 12:11:47

远方不远ss · 发表于 2021.3.11 11:21:11

太赞了吧

2012csc · 发表于 2021.3.13 11:40:12

lxy1921 · 发表于 2021.3.15 09:41:51

远方不远ss · 发表于 2021.3.15 11:57:55

顶！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！

2012csc · 发表于 2021.3.23 09:47:55

蓝色之恋 · 发表于 2021.3.23 21:24:03

不错不错，很有帮助