跪求GO、KEGG分析方法、流程

dqg · 发表于 2016.3.15 22:55:55

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比如我想做100个差异基因的GO分析，及KEGG。该用什么软件分析，及流程

zt1989 · 发表于 2016.3.16 10:30:47

首先你是做模式生物还是非模式生物的，模式生物你可以去DAVID等网站做GO富集分析，植物的话可以去AgrioGO.
如果你不是做模式生物的，你首先注释你所有的基因的GO的ID，然后那你感兴趣的基因做超几何检验
我常使用的R包有GOstats。

panda · 发表于 2016.3.16 17:35:56

北大开发的kobas也挺不错的，是基于序列做的

RainingDing · 发表于 2016.3.17 09:23:06

kobas基于基因ID也是可以做的，同时做GO和KEGG的富集

基迪奥小师妹 · 发表于 2016.3.17 09:36:34

我们基迪奥的在线生物信息云工具网站也是可以做GO和KEGG富集分析的~~不需要生物信息编程基础，操作简单易懂，出来的结果丰富全面，跟我们流程跑出来结果是一模一样滴~~

马上3月底就要推出了，到时你可以自由注册使用呢~~敬请期待~~

dqg · 发表于 2016.3.17 09:52:23

基迪奥小师妹发表于 2016.3.17 09:36
我们基迪奥的在线生物信息云工具网站也是可以做GO和KEGG富集分析的~~不需要生物信息编程基础，操作简单易懂 ...

赞赞赞，急求。。。。

496071151 · 发表于 2016.3.17 11:06:59

基迪奥，你们能不能把你们的分析平台共享啊，这个很实用的

小瑶 · 发表于 2016.3.17 15:27:53

496071151 发表于 2016.3.17 11:06
基迪奥，你们能不能把你们的分析平台共享啊，这个很实用的

我们的生物工具平台快推出了，再等一下下~

496071151 · 发表于 2016.3.18 08:58:19

小瑶发表于 2016.3.17 15:27
我们的生物工具平台快推出了，再等一下下~

哦，我知道你们这个平台做的挺好的，那就先等等

zhouyulu · 发表于 2016.3.21 22:46:13

等等等，学学学

dqg · 发表于 2016.3.24 17:29:10

基迪奥小师妹发表于 2016.3.17 09:36
我们基迪奥的在线生物信息云工具网站也是可以做GO和KEGG富集分析的~~不需要生物信息编程基础，操作简单易懂 ...

亲，你们的平台什么时候推出啊，急求

基迪奥小师妹 · 发表于 2016.3.25 09:09:17

dqg 发表于 2016.3.24 17:29
亲，你们的平台什么时候推出啊，急求

三月底四月初就能推出来啦！敬请期待~~

wpf4320792 · 发表于 2016.3.25 11:04:07

顶顶顶，非常期待~~

fengqiu · 发表于 2016.3.25 19:56:30

非常期待

jianjian1105 · 发表于 2016.3.29 23:09:15

非常期待

网速卡卡 · 发表于 2016.4.2 19:20:32

panda 发表于 2016.3.16 17:35
北大开发的kobas也挺不错的，是基于序列做的

能告诉我KODAS怎么用吗

gefei511 · 发表于 2016.4.5 05:19:18

基迪奥小师妹发表于 2016.3.25 09:09
三月底四月初就能推出来啦！敬请期待~~

4月初了，出了吗

基迪奥小师妹 · 发表于 2016.4.7 10:57:57

今晚隆重推出，敬请期待！

janeolo · 发表于 2016.4.7 19:48:50

用软件KOBAS (http://kobas.cbi.pku.edu.cn/home.do) 进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes )代谢途径富集分析

开挂 · 发表于 2016.4.8 08:44:55

janeolo 发表于 2016.4.7 19:48
用软件KOBAS (http://kobas.cbi.pku.edu.cn/home.do) 进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ) ...

曾经尝试过，好像网站不好登陆啊

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