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[动植物重测序] 求可以做单倍型关联的软件

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超级版主

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发表于 2017.3.21 22:49:23 | 显示全部楼层 |阅读模式

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求问各位老师,有没有可以接收三种以上基因型的关联分析软件,因为我现在想做候选单倍型(每个单倍型都4-5个allele)的关联分析,(数量性状,自然群体,混合线性模型)

哈哈
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中华鲟

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发表于 2017.3.23 16:14:47 | 显示全部楼层
我也想知道,顶一下
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迅猛龙

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发表于 2017.3.24 20:53:07 | 显示全部楼层
好像 Plink和BEAGLE 可以,但我没试过
PLINK 1.07's --hap command 和 BEAGLE 3.3.2 instead of PLINK 1.9 for case/control haplotype association analysis.
http://www.cog-genomics.org/plink/1.9/ld#blocks
早上好
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中华鲟

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发表于 2017.3.27 19:47:11 | 显示全部楼层

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和楼主同样的困惑
加油
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钵水母

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发表于 2017.9.15 23:02:52 | 显示全部楼层
楼主找到了吗?还望不吝赐教!
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