16s数据分析中weight和unweight有什么不同？

xi

在16s数据分析中，pca和样品聚类分析中都用到了weight和unweight的不同计算方法来比较，这两个参数具体说明什么，体现什么差异呢？在线等。

麦克柴

weight和unweight是加权和非加权的意思：利用非加权的计算方法，主要考虑的是物种的有无，即如果两个群体的物种类型都一致，表示两个群体的β多样性最小。而加权方法，则同时考虑物种有无和物种丰度两个问题。如果A群体由3个物种a和2个物种b组成，B群体由2个物种a和3个物种b组成，则通过非加权方法计算，因为A群体与B群体的物种组成完全一致，都只由物种a和b组成，因此它们之间的β多样性为0。但通过加权方法计算，虽然A与B群体的组成一致，但物种a和b的数目却不同，因此两个群体的β多样性则并非一致。

xi

好详细的解释，灰常感谢

xi

麦克柴 发表于 2017.1.5 10:59
weight和unweight是加权和非加权的意思：利用非加权的计算方法，主要考虑的是物种的有无，即如果两个群体的 ...

感谢

基迪奥-小师兄

可以参考
http://www.omicshare.com/forum/thread-1447-1-1.html

北魏独孤

感谢分析，这个问题终于明白了