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1170527498a 2020.4.10 10:34
请问一下，用cuffcompare进行拼装好的转录本和lncRNA数据库中的lncRNA注释文件进行比对，classcode为“=”和“c”，就可以表示这个转录本是lncRNA吗？
1170527498a 2020.4.10 10:31
老师，想请教你几个问题
wanglongxin 2018.3.20 09:10
Ivan: 是加起来的。
明白了，谢谢
wanglongxin 2018.3.16 11:15
Ivan: 我的理解是大多数真核生物基因的外显子个数是大于等于2的，外显子个数太低，序列可信度比较低。
但是我做的是lncrna，lncrna也需要这样筛吗？
还有个问题，lncrna筛选的时候需要ORF长度小于100aa，如果有两到3个外显子区的话，是不是需要把这些exon区长度加起来才可以？
太感谢您了
wanglongxin 2018.3.16 08:54
您好，请问您做过lncrna分析吗？在鉴定lncrna时，CNCI默认保留两个以上外显子，也就是exon num，我不太明白为什么这样做，大神能否给解答一下？
minzhuo 2017.11.25 10:35
你好！我想请教一下，我想把我的转录组数据用mapman作图呈现出来，按照你分享的方法先上传fasta文件生成mapping文件，但在网站上的提交按钮后，就一直没有反应。我提交的是转录组测出来的clean data fasta文件。想问问你可能是哪儿出问题了。谢谢回复。
platove 2017.9.28 15:23
Ivan: SVG是一门语言，百度有教程。
这种图
直接解析aln格式吗
还是其它的格式？
platove 2017.9.19 10:49
Ivan: 我是用SVG画的。
格式咋整理呢，大神；求指点
platove 2017.9.16 19:03
大神你好，rnaplex的结果如何可视化呢？求指点
S20163040445 2017.8.31 16:20
你好！我近段时间做进化这一块，文件是mtDNA 序列文件。我想问有没哪个软件可以通过群体之间的遗传距离做这几个群体之间的进化树吗？
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