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[软件使用] 让人整个被惊艳住的示意图!大佬们的中心法则原来这样画

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发表于 3 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
上周给大家科普了如何绘制各种各样的DNA双螺旋结构,且双链会画之后,单链的RNA显然毫无任何难度。关于各类DNA双螺旋画法可详见推文:《看到科研大佬们的花式示意图,我的DNA动了!》

DNA和RNA拿捏住了,在我们重要的中心法则之中,三大法宝似乎还有个下游的东西没有涉及到?没错,那就是蛋白质!

我们以中心法则为例,这个东西大家应该经常会放在论文的前言、或者讨论部分,以及做组会汇报PPT等场合高频使用。

如果用示意图展现,大部分人可能是这样的↓↓:


稍微有点美观意识的可能会用PPT美化一下,变成这样的↓↓:


虽然没毛病,但是毫无出彩点,用者平平,观者无感。那么我们怎么能做的更好呢?同一个中心法则,我们来看看大佬们是怎么做的↓↓:

Fig1

Fig2

Fig3

Fig4

我们可以看到,蛋白质,还有形成蛋白质前的多肽链画法多种多样,但其实很简单。在科研示意图的绘制中,我们并不需要像蛋白质的3D二级结构那样准确展示,更多的是用一种简洁又美观的形式进行表达。

下面就为大家展示在各类示意图中,多肽链和蛋白质的几种常见画法!建议搭配文首DNA双螺旋绘制文章一齐食用,这样中心法则三大法宝全部拿捏!

·绘图使用软件: AI(Adobe illustrator)

首先,是翻译过程中的“小尾巴”多肽链画法,如Fig1和Fig2。

使用直线段工具绘制一条mRNA单链(一条水平长横线+N条垂直短竖线,可画好两条短竖线后直接Ctrl+D重复上一操作完成整条链绘制);再使用钢笔工具绘制核糖体(画三块儿图形,上、下及其中间,调整图形的图层顺序使之形成“包围感”,夹在mRNA链上),最后给mRNA链和核糖体上色(核糖体这里使用了网格工具添加高光,以增强立体感,不透明度调整为80%)。


使用椭圆工具在随意空白处绘制一个椭圆,修改好填充和描边颜色后保持选中状态,在画笔处新建一个以椭圆为笔触的图案画笔样式


使用铅笔工具绘制一条自己脑海中多肽链走向的弧线。


将弧线保持选中状态,点击新建的图案画笔样式,即可将样式赋予整条弧线。


接下来,我们通过修改描边粗细将肽链调整到合适的大小,将图层顺序位于核糖体之下。这样正在翻译过程中的一条多肽链就完成绘制啦!


一条mRNA链上不止一个核糖体在翻译,如Fig2,那么我们只需要将上一步画好的核糖体复制多个,再使用铅笔工具绘制不同长度和折叠状态的弧线与核糖体相连。


最后赋予弧线所需的图案画笔样式,再做好多肽大小和图层顺序的调节即可。


那么,折叠好后的蛋白结构在示意图中一般是怎么表现的呢?可以参考Fig3和Fig4。

这种能展现复杂缠绕结构的蛋白绘制方法很简单,同样通过定义图案画笔可得到,不过稍稍有些许不同,下面我们通过实操给大家展示。

先是错误示范:

使用铅笔工具绘制好蛋白结构线条轮廓,使用圆角矩形工具绘制好笔触并定义为图案画笔


将画笔样式赋予蛋白线稿。但因为原始的笔触是一个圆角矩形,这样画出来一段一段显然是有问题的。


现在是正确示范:

我们使用矩形工具椭圆工具分别绘制等宽的矩形和椭圆:

对于矩形,仅设置有填充色,我们使用直线段工具绘制两条水平直线并拼合在一起。

对于椭圆,同时赋予描边和填充色,绘制一条垂直线水平穿过圆形,使用小黑工具全部选中并使用形状生成器(快捷键Shift+M)生成两个半圆,复制多一组(一组仅填充色,一组仅描边色),将仅有描边色的一组使用剪刀工具进行切割,只留下圆弧部分,和另一组拼合在一起。虚线框中即为我们最后所需部分。


我们把所需要的三个形状分别选中后用鼠标拖拽到色板中,如下图。


接着开始定义图案画笔,在新建画笔选项面板中,虚线框位置分别表示:外角拼贴、边线拼贴、内角拼贴、起点拼贴和终点拼贴。在边线拼贴、起点拼贴和终点拼贴选择我们上一步拖到色板中的对应图形,最后在外角和内角拼贴处选择自动居间即可。


将定义好的图案画笔赋予线条,存在折叠缠绕关系的蛋白质结构示意图就画好啦。当然,你还需要根据自己的实际需求去调整大小(改变描边粗细)。


我们仔细观察Fig3和Fig4,发现其实还是差一点细节。首先,人家的蛋白似乎缠绕的更复杂,我们所绘制的蛋白仅按照铅笔的顺序来展现先后叠加;其次,人家的蛋白还有高光。

那么如果有小伙伴想要精益求精,接下来就是一些进阶调整。如何给蛋白加高光显得更加立体呢?其实就是在原本的矩形中加一条浅粉色的直线,调整不透明度和粗细到自己满意,拖到色板再按照上述步骤定义一个新图案画笔即可。


新图案画笔效果如下。大家还可以在首尾的半圆处也做一个这样的处理,会衔接得更加自然,这里就不再演示了(有兴趣的当成作业去尝试下)。


其次如何使蛋白缠绕得更为复杂?使用小黑工具选中路径,在菜单栏选择对象——拓展外观


我们观察下拓展外观后的路径,其实就是把我们原本的线条转换为由所设定的图案效果。那最后需要做的,就是选中一些交叠处图形,改变此处图形堆叠的上下层关系。


如使用小黑工具同时选中(按住Alt加选)置于上层的这几个连续图形,鼠标右击选择排序——置于底层


现在这一段就被我们改变顺序并置于下层啦!通过重复这个操作我们就能使蛋白缠绕得更为复杂。


最后,我们可以向Fig4那样,把画好的蛋白结构放在不同颜色的椭圆圈中,表示不同种类的蛋白质。最后结合上一期的DNA和RNA,加上色块儿、文字、箭头等元素,文首的示意图还不是轻轻松松!


好啦,今天的分享就到这里。DNA、RNA、多肽和蛋白,你拿捏住了么?

本文作者:基迪奥-喵酱

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看着好看,但就是懒得画。。
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