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34个生信工具横空出试

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迅猛龙

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发表于 2021.5.14 15:10:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 基迪奥-Jt桃 于 2021.5.14 17:18 编辑

毕业季 你在为数据挖掘发愁么
论文提交deadline 你的图表绘制好了么
还在盯着代码 找程序报错原因么
……

无需编程 即可绘制SCI文章图表的OmicShare生信工具了解一下

每个月20000+项目数,热图引用累积几百加,70000多用户的心头好KEGG富集、GO富集工具,PCA、维恩图出图后可继续精细调整……

这些基迪奥最早上线、经过N轮优化的工具,现在首次开放免费试用了,每个工具都可以免费试用2次,注册账号即可试用

工具网址:

免费试用工具包括:


出图效果:

1.热图


OmicShare有多个热图绘制工具,除了大家熟悉的热图、动态热图工具,还有二值热图、动态相关性热图(组间)等,绘制相关性热图时,还可以添加显著性标记。

2.韦恩图


OmicShare的动态Venn图工具,可以直接使用微生物丰度表或着基因表达量表绘制韦恩图,当样本数量大于5个,会直接绘制漂亮的“花瓣”韦恩图!。

3.小提琴图


小提琴图工具,可以绘制展示微生物种群密度或基因表达量分布的小提琴图,而动态小提琴图工具有更强的交互性,在拿到绘图结果后仍可以做进一步的精细调整。

4.主成分分析


OmicShare 的PCA工具非常受欢迎,而新推出的动态PCA工具功能更加强大,除了支持对PCA结果图表进行精细调整外,还可以一键添加置信区间。

5.动态趋势分析


根据基因在不同样本的表达量,将表达趋势相似的基因进行归类,不同处理组(3~5个)之间一般要求具有梯度(如不同的处理时间、浓度、温度,海拔高度等),通过趋势分析可以找到具有相同表达模式的基因以及蛋白或代谢物等。

6.KEGG富集分析高级版


在生物体内,不同基因通过相互作用行使生物学功能。KEGG富集分析主要通过超几何检验,找出目的基因集(一般为差异表达基因)中显著性富集的Pathway,KEGG富集分析高级版工具除了生成常规的富集分析条形图、气泡图,还生成KEGG富集圈图。

7.kegg高级网络图


网络图是用于显示不同事物之间关联方式的可视化方法。在KEGG富集分析中,不但可用网络图呈现各个通路之间的关系,还可呈现通路与基因的关系。直接从整体上展现通路与通路、通路与基因的关系。



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