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楼主: yuzhe891

[其他] 提取建库栏,不能全是提RNA,DNA的帖子,也得有建库贴!

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钵水母

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发表于 2017.3.23 15:49:50 | 显示全部楼层
同求中文版的,学习学习= =万谢
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草履虫

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发表于 2017.5.11 15:57:59 来自手机 | 显示全部楼层
zhouqian2617 发表于 2016.5.8 21:14
有个问题,建库过程中rRNA污染是怎么来的,如何避免

没有去除干净
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草履虫

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发表于 2017.5.11 15:58:41 来自手机 | 显示全部楼层
zhouqian2617 发表于 2016.5.8 21:14
有个问题,建库过程中rRNA污染是怎么来的,如何避免

没有去除干净
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草履虫

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发表于 2017.9.6 11:06:43 | 显示全部楼层
zhouqian2617 发表于 2016.5.8 21:14
有个问题,建库过程中rRNA污染是怎么来的,如何避免

根据这个问题,应该是问的转录组测序吧,一般如果是Illumina的kit的话,都会有专门的去除rRNA的beads,经过这个步骤,基本上都去除干净了,你提到的污染问题,可能有以下原因,附上可能的解决方法:
1.建库过程中没有完全按照kit的protocol来操作,造成中间环节出错而污染。这个一定要严格按照kit的protocol来的,人家的研发人员经过上百上千次实验摸索出来的体系和时间,我们没有必要修改了。
2.建库过程中使用去除rRNA的beads时,本来应该去除上清,保留beads的,弄错了,或者是去除上清的时候没有去除干净,解决办法可以考虑细一点的10ul枪头,将需要去除的上清吸到底,而且要保证在磁力架上的时候吸,不要从磁力架上取下来,不然会有rRNA的残留
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中华鲟

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发表于 2017.12.5 09:10:54 | 显示全部楼层
谢谢分享
加油,顺顺利利~!
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草履虫

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发表于 2018.7.20 17:54:50 | 显示全部楼层
楼主,同要中文版的,邮箱ganzhouhm1993@163.com,谢谢楼主的共享。
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中华鲟

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发表于 2019.11.19 08:37:02 | 显示全部楼层
感谢楼主分享~~~
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钵水母

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发表于 2019.11.29 14:27:39 | 显示全部楼层
尽快给看看韩国
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中华鲟

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灌水之王


发表于 2020.4.21 12:06:48 | 显示全部楼层
谢谢分享
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中华鲟

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灌水之王


发表于 2020.5.24 08:05:02 | 显示全部楼层
看评论学习一下
新的一天加油!
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