求推荐BS-seq分析软件

Isoforms · 发表于 2016.4.11 16:44:08

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第一次做甲基化分析，想寻找一个比较靠谱的全基因组甲基化分析软件，哪位大神能推荐一下

Isoforms · 发表于 2016.4.11 16:45:31

我处理的物种是拟南芥

基迪奥-周煌凯 · 发表于 2016.4.12 09:23:25

你可以去这个网站找找：

【2014】Database，OMICtools，一个生物信息软件的分类网站
http://www.omicshare.com/forum/f ... =279&fromuid=12
(出处: OmicShare Forum)

Isoforms · 发表于 2016.4.12 14:54:13

基迪奥-周煌凯发表于 2016.4.12 09:23
你可以去这个网站找找：

【2014】Database，OMICtools，一个生物信息软件的分类网站

谢谢大神

基迪奥-周煌凯 · 发表于 2016.4.12 22:57:10

Isoforms 发表于 2016.4.12 14:54
谢谢大神

比对软件比较主流的是： Bismap 或 Bismark，各有特点，建议你两个都试试。

差异甲基化分析，可以参考附件文献。

zhaoyuewan · 发表于 2021.3.6 10:17:00

Detection of differentially methylated regions from whole-genome bisulfite sequencing data without replicates

[Bisulfite] 求推荐BS-seq分析软件