翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。
利用翻译组测序可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等,结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析,可以更精确地研究转录后调控、翻译调控机制。
本系列课程介绍了如何利用翻译组学这项新测序的技术,揭示编码基因的翻译调控机制以及非编码基因可编码小肽的能力。
常见的翻译组测序方法包括多聚核糖体分析技术、核糖体足迹测序、全长翻译组测序和核糖体亲和纯化技术。其中Ribo-seq是对与核糖体结合的正在翻译过程中的mRNA片段进行富集和测序,被认为是能够对体内翻译和协同的共翻译事件进行全局分析的变革性技术。
本系列课程重点讲解ribo-seq测序技术,分享ribo-seq的分析内容,包括与转录组结合分析,以及非编码RNA编码能力分析的一些分析点,并且重点结合基迪奥高分文章案例,分享翻译组测序这项新技术的发文思路。
环状RNA翻译和常用验证方法介绍,侧重于医学和生物学功能机制等方面,特别是对环状RNA翻译功能进行了介绍。在第二章节中,与大家分享下农学动植物环状RNA研究概况,分享几个经典案例,为研究经济动植物环状RNA提供一些思路。
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