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课程-单细胞全转录组

单细胞全转录组测序(scFAST-seq)的技术通过结合高逆转录效率的随机引物和自研的高效rRNA去除方法实现了对单细胞转录组的序列全长覆盖的随机捕获,即便是不具有ploy A尾的lncRNA,又或是以前传统单细胞转录组技术捕获得到的circRNA,这次,也都能在单细胞级别上捕获得到了!

此外,这个技术也可以捕获得到很多序列层面的信息,比如,可变剪切位点,或是基因突变位点……综合各方面的数据“扩充包”,这项技术可以使得序列研究更精细,上下游调控机制更完善,细胞拟时分化路径更还原。

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单细胞组学测序是一种能够对单个细胞进行基因组、转录组和表观组等方面的高通量测序技术。随着单细胞测序技术的不断发展,它在生命科学研究中的应用越来越广泛,其中大部分的单细胞转录组测序技术仅能捕获单端poly A尾的mRNA,获得的数据也就存在一定的局限性,因此单细胞转录组研究也逐渐趋于同质化。

而单细胞全转录组测序(scFAST-seq)的技术将会大大改变现状——其通过结合高逆转录效率的随机引物和自研的高效rRNA去除方法实现了对单细胞转录组的序列全长覆盖的随机捕获,即便是不具有ploy A尾的lncRNA,又或是以前传统单细胞转录组技术捕获得到的circRNA,这次,也都能在单细胞级别上捕获得到了!

此外,这个技术也可以捕获得到很多序列层面的信息,比如,可变剪切位点,或是基因突变位点……综合各方面的数据“扩充包”,这项技术可以使得序列研究更精细,上下游调控机制更完善,细胞拟时分化路径更还原。

  除了介绍这个技术的原理与特色分析内容外,基迪奥也是从其他技术的应用案例中挖掘到了不少此技术的应用情景,用于解决切实的生物学问题。如果你不仅想研究单细胞层面的基因表达,而且还想深入挖掘非编与编码RNA的机制调控,又或是想了解单细胞级别的序列变化信息,那么这个单细胞全转录组技术,绝对是你不容错过的!


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