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功能
盒形图用于展示样本数据的分布情况。
适用范围
适用于转录组、代谢组、蛋白组、微生物以及常规实验结果等所有适合绘制盒形图的数据，如基因表达量表、代谢物丰度表、微生物丰度表等，也可以是表型数据，例如株高、体重等生理指标。
输入
文件格式：支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。文件名可由英文和数字构成，文件拓展名没有限制，可以是“.txt”、“.xlsx”、“.xls”、“.csv”等，例如 mydata01.txt，gene02.xlsx 。表格名称以字母、数字、下划线组成，不可以有空格。
数据整理：必须带表头，即列名，行名有无均可。制图时将以第一行为x轴。输入源文件的数量一般不超过3个。
参数设置
自定义颜色：需要注意颜色数量要与输入文件个数相等，不填则用系统默认颜色。
修改颜色注意事项：
① 添加/修改颜色可用十六进制格式或英文书写(如有三个输入文件，颜色可定义为black,green,red或#000000,#008000,#FF0000，注意每个颜色用逗号隔开)。
② 还可直接通过调色板选取需要的颜色：点击带颜色小方格，在色板中选中所需颜色后点击添加该颜色即可。
Y轴范围：即最小值到最大值，不填则默认不设置范围区间。
是否有行名：根据输入源文件内是否有行名进行选择。
输出
可输出pdf和png两种图片格式盒形图到本地。
一．数据整理：文件格式及数据内容详见说明部分。
二．文件输入：
以示例文件为例：
点击“选择文件”将源文件置入；点击“增加/删除表格”则可增加/减少输入源文件（一个文件表示一个分组）的个数。
三．参数设置：
自定义颜色：详见说明，需注意颜色数量要对应输入源文件个数，不填则用系统默认颜色。
Y轴范围：可设定希望的Y轴范围，及最小值到最大值。
是否有行名：根据输入源文件有无行名选择是否。
四．文件输出：
在“我的项目”中查看任务进度及结果，点击“预览”可在线查看盒形图，在预览页面可选择下载不同格式的图片到本地。
盒形图
Q1. 上传的数据需要保存成什么格式？文件名称和拓展名有没有要求？
OmicShare当前支持txt(制表符分隔)文本文件、csv(逗号分隔)文本文件、以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。如果是核酸、蛋白序列文件，必须为FASTA格式（本质是文本文件）。
文件名可由英文和数字构成，文件拓展名没有限制，可以是“.txt”、“.xlsx”、“.xls”、“.csv”“.fasta”等，例如 mydata01.txt，gene02.xlsx 。
Q2. 提交时报错常见问题：
1.提交时显示X行X列空行/无数据，请先自查表格中是否存在空格或空行,需要删掉。
2.提交时显示列数只有1列，但表格数据不止1列：列间需要用分隔符隔开，先行检查文件是否用了分隔符。
其它提示报错，请先自行根据提示修改；如果仍然无法提交，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
Q3. 提交的任务完成后却不出图该怎么办？
主要原因是上传的数据文件存在特殊符号所致。可参考以下建议逐一排查出错原因：
（1）数据中含中文字符，把中文改成英文；
（2） 数据中含特殊符号，例如 %、NA、+、-、（）、空格、科学计数、罗马字母等，去掉特殊符号，将空值用数字“0”替换；
（3）检查数据中是否有空列、空行、重复的行、重复的列，特别是行名（一般为gene id）、列名(一般为样本名)出现重复值，如果有删掉。
排查完之后，重新上传数据、提交任务。如果仍然不出图，可通过左侧导航栏的“联系客服”选项咨询OmicShare客服。
Q4.下载的结果文件用什么软件打开？
OmicShare云平台的结果文件（例如，下图为KEGG富集分析的结果文件）包括两种类型：图片文件和文本文件。
图片文件：
为了便于用户对图片进行后期编辑，OmicShare同时提供位图（png）和矢量图(pdf、svg)两种类型的图片。对于矢量图，最常见的是pdf和svg格式，常用Ai(Adobe illustrator)等进行编辑。其中，svg格式的图片可用网页浏览器打开，也可直接在word、ppt中使用。
文本文件：
文本文件的拓展名主要有4种类型：“.os”、“.xls”、“.log”和“.txt”。这些文件本质上都是制表符分隔的文本文件，使用记事本、Notepad++、EditPlus、Excel等文本编辑器直接打开即可。结果文件中，拓展名为“.os”文件为上传的原始数据；“.xls”文件一般为分析生成的数据表格；“.log”文件为任务运行日志文件，便于检查任务出错原因。
Q5. 提交的任务一直在排队怎么办？
提交任务后都需要排队，1分钟后，点击“任务状态刷新”按钮即可。除了可能需运行数天的注释工具，一般工具数十秒即可出结果，如果超出30分钟仍无结果，请联系OS客服，发送任务编号给OmicShare客服，会有专人为你处理任务问题。
Q6. 结果页面窗口有问题，图表加载不出来怎么办？
尝试用谷歌浏览器登录OmicShare查看结果文件，部分浏览器可能不兼容。
案例1:
发表期刊：BMC microbiology
影响因子：4.2
发表时间：2023
Fig.1 C The Box-plot of Bacillus phage sequence and genome size, including the 619 prophage sequences and the 236 lytic phage genomes.
引用方式：
The Box plot was drawn by the OmicShare tools, an online platform for data analysis (https://www.omicshare.com/tools).
参考文献：
Zhang Y, Miao J, Zhang N, et al. The analysis of the function, diversity, and evolution of the Bacillus phage genome[J]. BMC microbiology, 2023, 23(1): 170.
案例2：
发表期刊：Journal of Experimental Botany
影响因子：6.9
发表时间：2020
Fig. 6. Differential methylome analysis in ZB and ZBR under HT stress. (A) Box plot showing the ML of differentially methylated regions (DMRs) for four cotton samples.
Zhang M, Zhang X, Guo L, et al. Single-base resolution methylome of cotton cytoplasmic male sterility system reveals epigenomic changes in response to high-temperature stress during anther development[J]. Journal of Experimental Botany, 2020, 71(3): 951-969.
案例3：
发表期刊：BMC microbiology
影响因子：4.2
发表时间：2023
Fig 1.The information of Bacillus phage sequences and genomes including functional classification of proteins encoded by Bacillus phage and the size of Bacillus phage sequences and genomes. C The Box-plot of Bacillus phage sequence and genome size, including the 619 prophage sequences and the 236 lytic phage genomes
The bar chart was drawn by graphpad prism 9.5.1, and the Box plot was drawn by the OmicShare tools, an online platform for data analysis (https://www.omicshare.com/tools).
参考文献：
Zhang Y, Miao J, Zhang N, et al. The analysis of the function, diversity, and evolution of the Bacillus phage genome[J]. BMC microbiology, 2023, 23(1): 170.