功能：
在生物体内，不同基因相互协调行使其生物学功能，基于Pathway的分析有助于更进一步了解基因的生物学功能。KEGG是有关Pathway的主要公共数据库。 Pathway显著性富集分析以KEGG Pathway为单位，应用超几何检验，找出与整个基因组背景相比，在差异表达基因中显著性富集的Pathway。
P的计算公式 其中，N为所有基因（背景基因）的数量，n为差异基因（目的基因）的数量，M为所有基因中该pathway的数量，i为差异基因中注释到该pathway的数量，计算得到的pvalue通过FDR校正之后，以corrected-pvalue≤0.05为阈值，满足此条件的pathway定义为在差异表达基因中显著富集的pathway。

输入：

①输入的表格文件，必须为txt格式。可以选择在excel中将数据打开，然后另存为"文本文件(制表符分隔)(*.txt)"。

②富集的目的基因列表，即想要研究的基因列表，每行第一列为基因id，要包含在背景基因表中.注意此文件不用加行名。 注意此文件第一行不是文字说明的行名，直接就是具体的基因ID号,请查看例子文件格式。

③背景基因总表，即所有基因的列表，第一列为基因id，第二列为用于获取pathway的一个id，有3种类型：
   类型1：kegid，例如mmu:18053，即KEGG官网上的id，可以通过KEGG注释或者KEGG官网获得。
   类型2：ncbi-geneid，例如18053，即ncbi上得到的geneid，一连串数字组成。
   类型3：KO号，例如K10942，不同物种间相同KO号会有对应不同的pathway的情况，详情可以查看KEGG官网，直接通过KO号获取pathway会不准确。建议通过前两种类型来获取。
   类型4：类型4，kopath，为本公司提供的类型文件，第一列为基因id，第二列为KO好，第三列为通路编号，以“，”分隔，第4列为kegid。

④基因差异表达差异倍数表：第一列为基因ID，第二列为差异表达倍数log2(FC)。