动态GO富集分析

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输入:

①输入的表格文件,必须为txt格式。可以选择在excel中将数据打开,然后另存为"文本文件(制表符分隔)(*.txt)"。 也可以输入两列,diff是差异结果,第二列为差异倍数取log2,大于0上调,小于0下调,此时参数应选择diff。

②富集的目的基因列表,即想要研究的基因列表,每行第一列为基因id,基因id要包含在背景基因表中。

③背景基因总表,如果是有参考基因组的模式生物,可以直接使用已有参考基因作为背景基因文件。目前提供的物种有水稻、拟南芥、小鼠、大鼠、斑马鱼、鸡、秀丽线虫、果蝇、人。ID类型可选择基因ID或转录本ID,根据富集目的基因的ID类型决定。可以点击“预览参考文件”来查看具体ID。
如果所研究物种不在以上范围,则需要自行准备GO背景基因文件。现在支持两种格式。第一种:格式为第一列为基因id,第二列为GO注释结果。第二种:同一个基因的所有GO号会在同一行并列给出。项目提交后,程序会自动判断处理。如下图所示:

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总览



结果统计表



二级分类柱状图



显著性气泡图


结果展示