表观组学研究专题
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当下游的基因研究积累到一定经验之后,我们往往开始关注上游存在的调控机制。表观遗传学是诠释可遗传的基因表达记忆的建立和细胞代间传递的、而并非由DNA排序决定的机制的一门学科。研究涉及DNA甲基化、RNA甲基化、DNA-蛋白相互作用、染色质可及性、组蛋白修饰等方面,以解读位于基因型和表型之间的规律。本系列课程将重点介绍表观组学研究的方法及应用。
转录组测序后该做什么?当下游的转录研究累积到一定经验之后,我们往往开始关注转录组的上游--转录前调控。转录因子与DNA结合介导基因的转录过程,是转录前调控的重点研究对象,第一章为大家详述挖掘转录因子调控位点的新技术:DAP-seq。
在基因组开放性检测的方法中,目前最强大最主流的技术是ATAC-seq。ATAC-seq(染色质易开放区域测序)是利用Tn5转座子酶对基因组的染色质进行切割并引入测序接头,然后构建文库,对基因组上的开放染色质进行测序的一种技术。ATAC-seq将表观研究的本质聚焦到染色质的易接近性变化,是联系复杂表观/转录调控与转录组变化的关键点,可将表观遗传研究化繁为简。第二章为大家讲解ATAC-seq专题。第三章重点介绍DNA甲基化研究,最后通过文章案例分享表观研究思路。
部分PPT内容:
章节
第1章DAP-seq研究介绍购买本章
1-1 DAP-seq:转录调控位点挖掘新模式
第2章ATAC研究介绍购买本章
2-1 ATAC-seq专题(上)——转录调控研究的新密钥
2-2 ATAC-seq专题(下)——基于ATAC-seq的高分文章思路解析
2-3 基于ATAC-seq的高分文章思路解析
第3章DNA甲基化研究介绍
第4章RNA甲基化研究介绍购买本章
4-1 新技术6mA甲基化助力高分文章
4-2 m6A:一项完美填补表观研究空白的技术
4-3 lncRNA关联m6A甲基化的应用思路
4-4 m6A+翻译组关联分析策略和案例解析
第5章表观组学研究思路解析购买本章
5-1 转录调控新技术的高分应用策略
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讲师
周老师
OmicShare在线课堂首席讲师,江湖人称“周老师”。有丰富的高通量测序数据挖掘经验,精通统计学、R语言、重测序等领域。
基迪奥-小师兄
已从事多年微生物研究,具有丰富的分子克隆和高通量测序经验,擅长微生物群落和单菌体研究。
基迪奥-阿拉雷
基迪奥产品经理,目前从事微生物及表观修饰产品开发工作,喜欢研究各类型生物学问题。
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