Origin 科研作图系列教程
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不论是文章发表还是学术报告,专业漂亮的图表无疑会给你的工作加分不少。对于常见科研作图软件,R(ggplot2包等)、Matlab、Python需编程基础; Origin、 Graphpad Prism、 Sigmaplot的图表风格为SCI风,图形界面,只需要点鼠标基本上可完成绘图操作;而Excel是面向办公大众的,图表风格偏商,需花时间做个性化调整。
个人以为Origin的绘制的初始图表是最接近发表要求的,而且,图表上所有的图形元素(小到坐标轴的gap、刻度线的朝向、长短等)基本上都可以个性化调整,有非常大的个性化调整空间。Origin有丰富的图表模板库,如果没有反复批量绘制图表的需求, Origin足以满足一般的科研工作者。
图1.部分Origin的绘制的图表(官方案例)
当然,Origin还有大量的插件,使用插件可以实现更多的统计分析和作图功能。当然,Origin自带的统计功能也很强大,比如可以做方差分析、主成分分析(PCA)、生存分析等,只不过因其作图功能太过强大而较少关注而已。
图2.部分Origin插件列表
Origin是公认的绘制科研图表的专业软件,具有一定的学习门槛。初学者要学习Origin,免不了花时间花精力去寻找教程资料。网上虽也能找到相关的Origin视频教程,但数量较少且都是10多年前的版本。
本课程从前面部分基础操作部分到后面的案例提高部分,皆以实例作图的形式贯穿始终,在操作过程中介绍作图的思路和技巧。为了方便大家练习使用,课程提供示例图表的工程文件和相关插件。另外,因为软件是英文界面,课程中会附加界面中英文词汇的翻译,以便于初学者理解记忆。
图3.基本的图表图形元素
本课程适用于从未接触过Origin但想画出发表级图表的萌新、正在写论文想快速上手出图的研究生,以及那些对图表美观程度有极致要求的学者。希望学完之后能举一反三,绘制出范例中没有的,更具个性化的图表,比如重绘单细胞t-SNE散点图、拟时间热图、GSEA点线图等。
图4.绘制t-SNE散点图和GSEA点线图
以下图表也都是由Origin绘制的:
图4.部分使用Origin绘制的图表
最后,提醒大家这是实操课程,不是讲座,电影或是综艺节目!请边看视频边跟着操作,如果只用眼睛看,无聊、也没有意义,一觉醒来,了无痕迹!课堂中用到的示例文件可通过视频窗口左侧(或下方)的资料区下载,学习过程中有任何疑问,都可在课程页面联系OmicShare客服。
章节
第1章origin个性化科研作图体验课
第2章Origin的基础操作购买本章
2-1 Origin界面介绍、条形图的绘制
2-2 Origin图表的精细调整
2-3 Origin图表的保存设置
2-4 用Origin进行方差分析、绘制图表
第3章实例提高与作图技巧购买本章
3-1 案例一:Origin双Y轴柱状图绘制
3-2 案例二:Origin箱型图的绘制
3-3 案例三:Origin散点图的绘制与曲线拟合
3-4 案例四:Origin三元气泡(散点)图的绘制
3-5 案例五:Origin相关性热图的绘制
3-6 案例六:Origin"聚类"热图的绘制
3-7 案例七:Origin"地图"图表的绘制(上)
3-8 案例八:Origin"地图"图表的绘制(下)
3-9 案例九:Origin主成分分析与作图
第4章高级绘图功能专题详解购买本章
4-1 案例十 使用Origin2019绘制热图
4-2 案例十一 Origin分边小提琴(Split violin)的绘制
4-3 案例十二: Origin桑基图(Sankey plots)的绘制
4-4 案例十三:Origin火山图(Volcano plots)的绘制
4-5 案例十四:使用Origin进行图表排版
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讲师
基迪奥-莫北
精通origin、excel、Prism、AI等多种科研画图工具,熟悉R语言,擅长挖掘、测评各种科研工具。
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