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蛋白组和代谢组理论介绍及数据分析

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蛋白质是生物体生命活动的物质基础,也是生物体新陈代谢过程的主要执行者。蛋白质组学目前已广泛应用于医学临床诊断、病理研究、动植物生长发育、逆境胁迫、药学药物靶点、药效评价等领域。

 

代谢物,作为现阶段分子调控研究中的最终响应产物,与表型连接最为紧密,其变化更是能直接地揭示基因的功能。代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,通过近几年的发展,已在植物生理学、遗传学、疾病机理等多个领域发挥越来越重要的作用。

 

如何从蛋白质组数据中筛选目标蛋白、利用代谢组数据获得目标代谢物?

如何绘制差异图形、基于R进行富集分析?

如何基于相关策略开展转录组+蛋白质组、转录组+代谢组、蛋白质组+代谢组关联分析?

 

本系列课程将分别从蛋白质组学、代谢组学的检测原理、组学分析方法、数据分析出发。有了一定基础后,进阶至转录组、蛋白组、代谢组关联分析,轻松get组学文章中的常用套路

 

第一章蛋白研究综述和R语言入门,主要介绍蛋白组学质谱检测内容、蛋白质组研究思路及其他前沿蛋白质组研究技术,并对R语言进行入门讲解;

 

 

第二章蛋白数据分析理论和分析操作,对蛋白质组学分析内容、数据挖掘思路、图形(常用数据库、差异分析、富集分析、GSEA、趋势分析)介绍,手把手教授使用R语言绘制常见图表;

 

 

第三章代谢研究综述和多元统计分析,主要内容为代谢组学常用质谱检测方法及代谢组学常用分析方法、思路和图形,同步教授常用分析软件的实操;

 

 

第四章多组学分析理论和操作,介绍多个组学相互关联分析的实验设计、分析方法及应用,以及相关绘图软件介绍及实操课程。

 

章节

第1章蛋白研究综述和R语言入门购买本章

1-1  蛋白组研究概述

1-2  R、Rstudio安装与R简介

1-3  变量与函数

1-4  编写脚本

1-5  R绘图基础

1-6  R统计基础

1-7  数据、图片的导出

第2章蛋白数据分析理论和分析操作购买本章

2-1  蛋白数据分析理论

2-2  差异图形绘制-小提琴图

2-3  差异图形绘制-火山图

2-4  差异图形绘制-热图

2-5  富集分析及图形绘制

第3章代谢研究综述和多元统计分析购买本章

3-1  代谢组研究概述(上)

3-2  代谢组研究概述(中)

3-3  代谢组研究概述(下)

3-4  代谢组数据分析操作

第4章多组学分析理论和操作购买本章

4-1  代谢组、蛋白组、转录组多组学关联分析

4-2  关联分析方法与绘图-相关性分析

4-3  关联分析方法与绘图-九象限图绘制

4-4  网络图介绍及基于cytoscape的网络调控关系绘制

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讲师

基迪奥-莫北

精通origin、excel、Prism、AI等多种科研画图工具,熟悉R语言,擅长挖掘、测评各种科研工具。

基迪奥-萌神

目前从事转录、蛋白和代谢组学方向的研究。热爱生活、沉迷生物,凭借兴趣和好奇心学而不厌。

基迪奥-zero

基迪奥OmicShare在线课堂讲师,在挖掘数据的路上

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