蛋白组和代谢组理论介绍及数据分析
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蛋白质是生物体生命活动的物质基础,也是生物体新陈代谢过程的主要执行者。蛋白质组学目前已广泛应用于医学临床诊断、病理研究、动植物生长发育、逆境胁迫、药学药物靶点、药效评价等领域。
代谢物,作为现阶段分子调控研究中的最终响应产物,与表型连接最为紧密,其变化更是能直接地揭示基因的功能。代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,通过近几年的发展,已在植物生理学、遗传学、疾病机理等多个领域发挥越来越重要的作用。
如何从蛋白质组数据中筛选目标蛋白、利用代谢组数据获得目标代谢物?
如何绘制差异图形、基于R进行富集分析?
如何基于相关策略开展转录组+蛋白质组、转录组+代谢组、蛋白质组+代谢组关联分析?
本系列课程将分别从蛋白质组学、代谢组学的检测原理、组学分析方法、数据分析出发。有了一定基础后,进阶至转录组、蛋白组、代谢组关联分析,轻松get组学文章中的常用“套路”。
第一章蛋白研究综述和R语言入门,主要介绍蛋白组学质谱检测内容、蛋白质组研究思路及其他前沿蛋白质组研究技术,并对R语言进行入门讲解;
第二章蛋白数据分析理论和分析操作,对蛋白质组学分析内容、数据挖掘思路、图形(常用数据库、差异分析、富集分析、GSEA、趋势分析)介绍,手把手教授使用R语言绘制常见图表;
第三章代谢研究综述和多元统计分析,主要内容为代谢组学常用质谱检测方法及代谢组学常用分析方法、思路和图形,同步教授常用分析软件的实操;
第四章多组学分析理论和操作,介绍多个组学相互关联分析的实验设计、分析方法及应用,以及相关绘图软件介绍及实操课程。
章节
第1章蛋白研究综述和R语言入门购买本章
1-1 蛋白组研究概述
1-2 R、Rstudio安装与R简介
1-3 变量与函数
1-4 编写脚本
1-5 R绘图基础
1-6 R统计基础
1-7 数据、图片的导出
第2章蛋白数据分析理论和分析操作购买本章
2-1 蛋白数据分析理论
2-2 差异图形绘制-小提琴图
2-3 差异图形绘制-火山图
2-4 差异图形绘制-热图
2-5 富集分析及图形绘制
第3章代谢研究综述和多元统计分析购买本章
3-1 代谢组研究概述(上)
3-2 代谢组研究概述(中)
3-3 代谢组研究概述(下)
3-4 代谢组数据分析操作
第4章多组学分析理论和操作购买本章
4-1 代谢组、蛋白组、转录组多组学关联分析
4-2 关联分析方法与绘图-相关性分析
4-3 关联分析方法与绘图-九象限图绘制
4-4 网络图介绍及基于cytoscape的网络调控关系绘制
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讲师
基迪奥-莫北
精通origin、excel、Prism、AI等多种科研画图工具,熟悉R语言,擅长挖掘、测评各种科研工具。
基迪奥-萌神
目前从事转录、蛋白和代谢组学方向的研究。热爱生活、沉迷生物,凭借兴趣和好奇心学而不厌。
基迪奥-zero
基迪奥OmicShare在线课堂讲师,在挖掘数据的路上
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