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表观组学理论与实操

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表观组学是近年来新兴的一门学科,因能与DNA以及RNA等传统组学之间进行互相印证补充等,在组学中处于比较重要的地位,目前也处于发高分文章的红利期,鉴于此,本系列课程将从技术原理、常用分析软件、研究思路等对表观组学进行全面的介绍,希望对老师们的课题研究有所帮助!

 

表型差异研究是通用的生物学研究起点,生物学课题中常用的表型差异有时间、空间、处理类型/梯度、代谢物、生理生化指标等。掌握表观组学实验设计思路、数据挖掘方法、多组学关联分析方法尤为重要。本课程分为三个章节,基迪奥将从基础概述出发,讲述表观组学的研究思路、组学技术介绍及数据挖掘。通过理论与实操相结合,可实现零生信基础也能上手表观组学的数据挖掘、个性化分析及图形绘制美化。

 

1章基础入门理论与实操

对表观研究前景意义、组学实验/辅助实验流程、研究思路;基础数据分析(reads、丰度表、peak等)、R语言入门等进行概括介绍。

 

2章单组学专题理论与实操

主要涉及组间差异分析的理论和R实操以及高级个性分析中的Motif、核小体足迹、转录因子等介绍和基于MEME软件的Motif预测。

 

3章多组学专题理论与实操

ATAC-seq/DAP-seqWGBS-seq/m6A-seq+RNA-seqm6A-seq+Ribo-seq通用关联思路,某些个性化关联思路,分型方法、可视化、结果解读、案例应用进行介绍以及相关性散点图等图形的绘制。

章节

第1章基础入门理论与实操购买本章

1-1  表观研究概述(上)

1-2  表观研究概述(中)

1-3  表观研究概述(下)

1-4  R、Rstudio安装与R简介

1-5  变量与函数

1-6  编写脚本

1-7  R绘图基础

1-8  R统计基础

1-9  数据、图片的导出

1-10  基础数据分析

1-11  IGV+AI-reads峰图绘制

第2章单组学专题理论与实操购买本章

2-1  组间差异分析

2-2  R语言图形绘制-火山图

2-3  高级个性化分析

2-4  MEME软件使用-Motif预测

第3章多组学专题理论与实操购买本章

3-1  多组学关联策略

3-2  R语言图形绘制-相关性散点图

3-3  R语言图形绘制-九象限图

3-4  R语言图形绘制-累积曲线

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讲师

基迪奥-莫北

精通origin、excel、Prism、AI等多种科研画图工具,熟悉R语言,擅长挖掘、测评各种科研工具。

基迪奥-小鱼儿

基迪奥新晋产品牛人,擅长微生物研究等领域,产品开发经验丰富,循循善诱,是个耐心十足的技术大咖。

基迪奥-阿拉雷

基迪奥产品经理,目前从事微生物及表观修饰产品开发工作,喜欢研究各类型生物学问题。

基迪奥-潇潇

基迪奥新晋产品经理

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