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课程-网络图理论与cytoscape操作
基于新版cytoscape软件,从网络图基础理论和绘图数据的准备开始,介绍背景知识。然后从图形美化(节点线调整、饼图+网络图组合图)和网络图筛选过滤(分别结合单组学、多组学案例特征,提供多种分离子网络的策略)两个层面进行详细操作演示。
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最新版网络图视频课程《网络图理论与cytoscape操作》上线啦!



视频课程主要内容:



第一节 网络图基础理论与数据准备
介绍常见网络图的类型,含义,构建原理,基本概念;并以大家都有的物种丰度表或者基因表达量表为起点,演示网络图数据准备的步骤和注意事项(视频附件提供mac、windows的不同版本软件,并介绍了软件的安装步

骤)。 


第二节 网络图丰富美化技巧
前面所有的网络图,cytoscape通通可以实现,我们的教程有操作演示哦!本小节介绍网络图节点、线的美化,包含数据导入、基础调整、高级调整以及组合网络图(比如饼图+网络图)、图例图片导出等,(视频附件提供所有演示数据的文档,方便大家下载,参考示例准备数据)。教学示例图如下:

图2 课程教学图形


第三节 网络图数据挖掘技巧

除了炫酷的图形美化技巧,Cytoscape的强大之处还在于数据挖掘的高效便利性。一般我们参与分析的数据,比如WGCNA的一个模块、多组学关联数据,经常包含几百几千的线或者点。如何从繁多冗余的信息中挖掘我们需要的网络关系,就需要对数据统计、层层分离,绘制子网络。
本小节课程,我们演示WGCNA(单组学)、miRNA-mRNA(两组学)、CeRNA(三组学)3份案例数据的子网络筛选过程,使用多种策略进行数据挖掘,方便大家结合自己的情景应用。

图3 网络图数据挖掘过程示例


本系列课程自上线起一周,全系列购买可获六折优惠!


欢迎感兴趣的小伙伴观看基迪奥课堂视频,和我们一起学习交流!

第1章  Cytoscape网络图(一) 购买本章
第2章  Cytoscape网络图(二) 购买本章
第3章  Cytoscape网络图(三) 购买本章

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