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维恩图还能筛选阈值?玩转3种维恩图绘制!!

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发表于 2022.8.3 11:48:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
维恩图(Venn diagram)想必大家都不陌生,可以展示不同集合间的共有、特有信息,除了测序数据分析,其余场景同样适用。
OmicShare Tools目前已上线3个维恩图工具,三者在结果及功能上也略有不同,适配多种情况。

工具链接:https://www.omicshare.com/tools/


维恩图

当分组为2-5组时,出图结果为普通韦恩图。可以展示出各组特有、以及组与组间共有的元素个数,点击图上的数字,既显示各集合中的元素。


左图分组为4组;右图分组为5组

分组≥6组时,如果还显示各分组间的交集,图片将会是这样的:


这样图片就略让人眼花撩乱了,数据也不那么清晰可读了。因此当分组≥6组时,OmicShare出图结果为花瓣维恩图,不显示组间交集元素。

各花瓣上的数字为各组特有元素个数、中间为所有组共有元素个数,点击数据可查看元素信息。


upset维恩图


当分组比较多,使用upset维恩图处理数据,结果就更加直观了。


通过观察各组点线及柱形图,各组别元素数目、组间特有及共有元素信息一目了然;即使5、6组数据,集合信息也比较直观、可读了。

动态丰度维恩图

动态丰度维恩图可以通过指定阈值的方式筛选每个样本或分组符合条件的元素,然后使用图形展示不同样本(分组)之间这些元素的共有关系。


我们可以上传包含不同样本基因、蛋白、代谢物、物种OTU等的表达量(或丰度)表格,或者是包含不同比较组的差异倍数、显著性P值表格,在作图完成后可对阈值进行筛选,绘制出符合阈值的交集信息。

注意:动态丰度维恩图不支持非数值数据


维恩图的配色也是亮点之一,维恩图、upset维恩图、动态丰度维恩图都可以自由调整颜色,绘制起来非常方便~!


在OmicShare轻松实现不同维恩图的绘制~~

如果想详细了解维恩图、upset维恩图的画法,欢迎收看往期文章
《简洁明了的upset维恩图,美观与可读性兼得!》
《SCI高颜值配图拿捏了!绘制可自由调色的韦恩图!》



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帝王蝶

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迅猛龙

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灌水之王


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帝王蝶

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钵水母

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钵水母

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中华鲟

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