RNA测序结果验证的问题

wjbtj · 发表于 2021.2.10 13:22:09

在很多文献中，用qRT-PCR验证RNA-seq的结果中，往往是qRT-PCR有误差线（error bar）而RNA-seq没有，这不是个例，很多文献的图就是这样的。我贴了几个文献的截图。但是这些文献表明进行测序都是至少三次生物学重复的，没有误差线不会是因为没有生物学重复的原因。但是RNA-seq没有误差线的原因，想请教一下。谢谢回答

shuibao1984 · 发表于 2021.2.11 19:24:05

是因为R-Seq得到的差异分析的结果是用Deseq2分析的，在用这个R包时本来就是要求有生物学重复的，计算的结果直接就是log(foldchange)值，而不是每个样本的结果，所以没有误差线。

wjbtj · 发表于 2021.2.12 18:04:19

shuibao1984 发表于 2021.2.11 19:24
是因为R-Seq得到的差异分析的结果是用Deseq2分析的，在用这个R包时本来就是要求有生物学重复的，计算的结果 ...

非常感谢

13570254292st · 发表于 2021.2.17 20:46:03

同问

kiz2011 · 发表于 2021.2.19 14:09:44

谢谢大神解惑

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