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[转录组] RNA测序结果验证的问题

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草履虫

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发表于 2021.2.10 13:22:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
在很多文献中,用qRT-PCR验证RNA-seq的结果中,往往是qRT-PCR有误差线(error bar)而RNA-seq没有,这不是个例,很多文献的图就是这样的。我贴了几个文献的截图。但是这些文献表明进行测序都是至少三次生物学重复的,没有误差线不会是因为没有生物学重复的原因。但是RNA-seq没有误差线的原因,想请教一下。谢谢回答

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钵水母

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发表于 2021.2.11 19:24:05 | 显示全部楼层
是因为R-Seq得到的差异分析的结果是用Deseq2分析的,在用这个R包时本来就是要求有生物学重复的,计算的结果直接就是log(foldchange)值,而不是每个样本的结果,所以没有误差线。
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草履虫

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 楼主| 发表于 2021.2.12 18:04:19 | 显示全部楼层
shuibao1984 发表于 2021.2.11 19:24
是因为R-Seq得到的差异分析的结果是用Deseq2分析的,在用这个R包时本来就是要求有生物学重复的,计算的结果 ...

非常感谢
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钵水母

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发表于 2021.2.17 20:46:03 | 显示全部楼层
同问
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中华鲟

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发表于 2021.2.19 14:09:44 | 显示全部楼层
谢谢大神解惑
加油哇各位打工人
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