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[转录组] 请求WGCNA的几个问题

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  • TA的每日心情
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    [LV.8]以坛为家I

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    发表于 2019.10.9 13:47:22 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    以我自己的课题为例,实验材料:野生型和突变体,各取3个组织(根、叶片、子叶),分为接菌和不接菌处理,取样时间点为4h和10h,3个重复,因此一共72个样品
    问题1:这个实验变量很多,适合做WGCNA分析吗?
    问题2:在样品中发现了极个别重复性不好的样品,是否在分析之前先剔除掉?
    问题3:在分析时需要将三种组织分开来分析WGCNA吗?还是将三种组织混在一起分析?
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  • TA的每日心情
    害羞
    1 小时前
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    [LV.9]以坛为家II

    迅猛龙

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    发表于 2019.10.9 16:21:13 | 显示全部楼层
    不同的组合  能解释不同的生物学问题。看你怎么想要啥了
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    草履虫

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    发表于 2019.10.9 19:00:44 | 显示全部楼层
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