一个简单高效的热图制作工具（hemi）【加了下载地址】

esther

来来来~看过来~给大家推荐一款简单高效的热图制作工具（Heml1.0），它完全不需要命令行！！工具里内置了多种色系，专治处女座！支持聚类！完全满足编程小白、编程大师等等对heatmap的所有需求！！可以改动X轴和Y轴标题的设置！！！需要的朋友mark起来吧！不用谢，请叫我活雷锋！！！

下载地址：http://hemi.biocuckoo.org/

不多说，先上图

Heml1.0数据导入支持excel，只要拖动鼠标，选择数值数据区域即可，默认是不显示X轴和Y轴标题的，如果需要，可以指定哪一行是x轴，哪一列是y轴。

技巧1：

导入数据前，先点击DEMO，选择好喜欢的色系，这样导入数据后，就直接以该色系画图了

然后，小伙伴们就可以自由的修改这个heatmap了，包括，X轴，Y轴标题角度，字体，整个图片旋转，边距等等，基本的需求都能满足。每次修改后，都需要点击REFRESH进行刷新。

技巧2：

如果绘制热图的数据跨度比较大，比如从1到100都有，那么强烈推荐先对数据做归一化，这个可以放心，软件能自动帮你完成，只需要两步,

1). 选择option的statistic按钮

然后在这里选择log归一化的方式

2）点击Bar面板，选择“Auto Fill”按钮，再点ok，然后refresh一下就好

Heml1.0这个软件还可以做聚类。你可以根据需要选择对哪个轴做聚类，只要选择参数面板上的Clustering复选框就可以，简单明了。

导出图片，右键点击图片，你会看到导出选项，也是很简单，支持png，jpg，tiff，以及3种dpi，足够满足paper发表的质量。

就这样，老板再也不用担心我的paper热图了！

（转自PLOB）

真心感觉不错~~大家给个赞憋

Flier

感谢楼主分享，不会写代码的苦逼正需要。:victory:

吓一跳糯米糍

感谢楼主，又发现一种画热图的方法了现在总共有三四种画热图的方法啦！不过还是写代码成就感高一点啊！

Flier

请问楼主这是什么鬼

Yang

marker，谢谢LZ

Flier

基本弄明白了，GET个新技能，感谢楼主！

esther

Flier 发表于 2015-12-18 10:21
基本弄明白了，GET个新技能，感谢楼主！

太棒了！！！

chenSH

大赞哟，可以不用代码，就做热图了。

BIG

在哪里下载 ，为啥找不到下载链接呢？

hufans417

在哪里下载 ，为啥找不到下载链接呢？

热图要制作

请问楼主 怎么没有看到链接地址啊

flowering

太好了

real

求软件Heml1.0下载链接。谢谢

Eric_Young

这个软件刚出来的时候用过，不错。当时还提交过bug~~

fengqiu

大赞，给力

zlbiochem

marker，谢谢LZ

开挂

确实不错
另附中文说明书链接：http://hemi.biocuckoo.org/download/HemI_Manual_Chn.pdf

maizemonom

有学习了一个新方法，顶一个

开挂

有没有可以解释下这个软件的聚类算法啊，周老师你一定可以懂吧

esther

开挂 发表于 2016.4.15 19:20
有没有可以解释下这个软件的聚类算法啊，周老师你一定可以懂吧

这真的要问周老师哇