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基迪奥Omicshare课堂68期:ATAC-seq(上)转录调控研究的新秘钥

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发表于 2019.4.9 09:19:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
在3月26日的微信文章中,我们提到定位染色质中的可变开放区,是寻找转录前调控核心因子的关键线索,并详细解析了转录前调控的各个关键要素(转录组测序之后该做什么?——基因组可接近性会给你线索)。这篇文章发出后点击率极高,可见大家普遍对这个领域很感兴趣。
在紧接着3月28日的微信文章中,我们进一步对基因组开放性检测的几种方法进行了介绍(详情戳这里)。

在基因组开放性检测的方法中,目前最强大最主流的技术是ATAC-seq。ATAC-seq(染色质易开放区域测序)是利用Tn5转座子酶对基因组的染色质进行切割并引入测序接头,然后构建文库,对基因组上的开放染色质进行测序的一种技术。

ATAC-seq将表观研究的本质聚焦到染色质的易接近性变化,是联系复杂表观/转录调控与转录组变化的关键点,可将表观遗传研究化繁为简。目前,ATAC-seq是表观研究的最新手段和高分文章的利器,文章数量以每年翻一倍的速度快速增长。


图1 谷歌学术检索“ATAC-seq”的文章数量

也许文字的描述会有些晦涩难懂,不如视频直播的讲解来的直观。所以在最新两期的Omicshare class中,我们将会围绕ATAC-seq展开主题课堂。本期(第68期)的在线课堂《ATAC-seq专题(上)-转录调控研究的新密钥》将为你带来ATAC-seq相关的基础知识。

本次在线课堂主要内容包括:

1. 基因组开放性检测为什么如此重要性
(1)介绍基因组开放性的概念
(2)基因组开放性对转录组调控研究的重要性
(3)调控基因组开放性的主要因素是什么

2. 基因组开放性检测方法的原理和比较;
比较包括ATAC-seq在内的几种基因组开放性检测方法的原理以及优缺点。

3. ATAC-seq的主要分析内容
(1)介绍ATAC-seq的主要分析内容
(2)ATAC-seq与其他组学关联的基本原理

主讲人:周老师时间:2019.04.11(周四)  下午4: 00
如果对ATAC-seq感兴趣的小伙伴们,点击 这里 提前报名哦~

BTW,既然是上集,自然还有下集了。在下一期的主题《ATAC-seq专题(下)——基于ATAC-seq的高分文章思路解析》中,我们将继续通过若干文章案例,解析ATAC-seq测序在具体研究领域的应用,敬请关注。

本文作者:周老师


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迅猛龙

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发表于 2019.4.9 15:42:00 | 显示全部楼层
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 楼主| 发表于 2019.4.9 18:04:38 | 显示全部楼层
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帝王蝶

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发表于 2019.4.10 08:49:33 | 显示全部楼层
又可以学习了
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钵水母

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发表于 2019.4.19 21:44:00 | 显示全部楼层
我错过了直播,请问能不能发一下视频或者视频连接,谢谢!!!
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 楼主| 发表于 2019.4.19 22:20:23 | 显示全部楼层
gillian 发表于 2019.4.19 21:44
我错过了直播,请问能不能发一下视频或者视频连接,谢谢!!!

http://www.omicshare.com/class/h ... 4/chpid/89/id2/MTI=
这是视频链接
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迅猛龙

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发表于 2019.4.21 07:53:27 | 显示全部楼层
加油啊
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钵水母

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发表于 2019.4.21 22:00:18 | 显示全部楼层
h666
发酵床你发错MV
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