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[动植物重测序] BSA方法定位QTL,确定阈值的时候置换检验是怎么做的啊?

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  • TA的每日心情

    2018.4.23 14:42
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    发表于 2017.5.25 22:55:46 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    使用BSA方法来定位主效QTL,获得的数据是一堆SNP的位点频率信息,从里边确定QTL区域的时候很多地方说可以用置换检验来确定阈值情况,在网上找到的关于置换检验的内容都是两个小样本进行差异分析的时候的指导做法,在这里怎么进行置换检验啊,求大神指点一下细节!!!
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  • TA的每日心情
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    发表于 2017.7.20 23:55:05 | 显示全部楼层
    这个比较复杂,你不会编程的话,还是放弃吧。 取 top 0.5 % 就可以了。
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  • TA的每日心情

    2018.4.23 14:42
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     楼主| 发表于 2017.7.21 08:09:11 | 显示全部楼层
    基迪奥-周煌凯 发表于 2017.7.20 23:55
    这个比较复杂,你不会编程的话,还是放弃吧。 取 top 0.5 % 就可以了。

    会的,主要瓶颈在不知道这个置换检验具体是怎么实施
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