查看: 5208|回复: 5

[其他] 甲基化结果数据在哪里下载?

[复制链接]

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
8
注册时间
2016.6.16
在线时间
61 小时

发表于 2017.3.31 20:02:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
小伙伴们谁知道人和拟南芥的甲基化数据的位置结果在哪可以下载到??不要原始结果类似这种结果格式的:



file:///



本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
回复

使用道具 举报

管理员

Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15Rank: 15

主题
49
注册时间
2015.12.5
在线时间
539 小时

活跃会员论坛元老


发表于 2017.4.14 08:14:13 | 显示全部楼层
每个个体的甲基化信息都不同。某些文章的甲基化结果,会上传到NCBI GEO 数据库,你可以去看看。
新的一天加油!
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
1
注册时间
2016.3.20
在线时间
5 小时

发表于 2017.5.4 13:15:22 | 显示全部楼层
这是bismark  extractor的结果CX report各个cytosine的甲基化、非甲基化reads覆盖信息
是很重要的中间文件
可以下载到
也可自己搞
****
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
8
注册时间
2016.6.16
在线时间
61 小时

 楼主| 发表于 2017.5.9 14:05:31 | 显示全部楼层
hmyh1202 发表于 2017.5.4 13:15
这是bismark  extractor的结果CX report各个cytosine的甲基化、非甲基化reads覆盖信息
是很重要的中间文件 ...

对于已有的,你知道在哪里可以下载到么??
回复 支持 反对

使用道具 举报

钵水母

Rank: 3Rank: 3

主题
1
注册时间
2016.3.20
在线时间
5 小时

发表于 2017.5.15 12:56:51 | 显示全部楼层
sunshine-girl 发表于 2017.5.8 20:05
对于已有的,你知道在哪里可以下载到么??

一版文章都提供了GEO编号或者NCBI的连接
****
回复 支持 反对

使用道具 举报

中华鲟

Rank: 5Rank: 5

主题
0
注册时间
2017.11.3
在线时间
183 小时

发表于 2017.11.23 13:39:58 | 显示全部楼层
NCBI或其它一些公共数据库应该有吧
加油,顺顺利利~!
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

快速回复 返回顶部 返回列表